Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNA6Q15825 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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