Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms