Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP1BQ14684 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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