Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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DDX39BQ13838 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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DDX39BQ13838 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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