Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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