Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF6Q13247 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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