Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSTF3Q12996 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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CSTF3Q12996 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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CSTF3Q12996 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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