Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFIAQ12857 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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