Protein–RNA interactions for Protein: Q12674

DNF3, Probable phospholipid-transporting ATPase DNF3, yeastyeast

Predictions only

Length 1,656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNF3Q12674 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-2.5□□□□□ -2.81
DNF3Q12674 YOR309CYOR309C 381 nt-2.5□□□□□ -2.81
DNF3Q12674 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-2.51□□□□□ -2.81
DNF3Q12674 HTL1YCR020W-B 237 nt-2.52□□□□□ -2.81
DNF3Q12674 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-2.52□□□□□ -2.81
DNF3Q12674 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-2.52□□□□□ -2.81
DNF3Q12674 BIL1YOR304C-A 231 nt-2.54□□□□□ -2.82
DNF3Q12674 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-2.55□□□□□ -2.82
DNF3Q12674 YJR157WYJR157W 363 nt-2.56□□□□□ -2.82
DNF3Q12674 YKL063CYKL063C 504 nt-2.56□□□□□ -2.82
DNF3Q12674 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-2.56□□□□□ -2.82
DNF3Q12674 YGL041CYGL041C 204 nt-2.58□□□□□ -2.82
DNF3Q12674 YBR178WYBR178W 375 nt-2.61□□□□□ -2.83
DNF3Q12674 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-2.63□□□□□ -2.83
DNF3Q12674 YEL014CYEL014C 306 nt-2.66□□□□□ -2.84
DNF3Q12674 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-2.66□□□□□ -2.84
DNF3Q12674 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-2.67□□□□□ -2.84
DNF3Q12674 snR78snR78 87 nt-2.72□□□□□ -2.84
DNF3Q12674 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-2.73□□□□□ -2.85
DNF3Q12674 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt-2.74□□□□□ -2.85
DNF3Q12674 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-2.74□□□□□ -2.85
DNF3Q12674 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-2.74□□□□□ -2.85
DNF3Q12674 YPR197CYPR197C 564 nt-2.76□□□□□ -2.85
DNF3Q12674 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-2.8□□□□□ -2.86
DNF3Q12674 snR55snR55 98 nt-2.82□□□□□ -2.86
DNF3Q12674 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-2.83□□□□□ -2.86
DNF3Q12674 YGR035CYGR035C 351 nt-2.88□□□□□ -2.87
DNF3Q12674 YOR102WYOR102W 351 nt-2.88□□□□□ -2.87
DNF3Q12674 YER181CYER181C 324 nt-2.89□□□□□ -2.87
DNF3Q12674 YDR413CYDR413C 576 nt-2.9□□□□□ -2.87
DNF3Q12674 YNR025CYNR025C 360 nt-2.9□□□□□ -2.87
DNF3Q12674 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-2.92□□□□□ -2.88
DNF3Q12674 ATP19YOL077W-A 207 nt-2.92□□□□□ -2.88
DNF3Q12674 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt-2.92□□□□□ -2.88
DNF3Q12674 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-2.94□□□□□ -2.88
DNF3Q12674 YPR012WYPR012W 255 nt-3□□□□□ -2.89
DNF3Q12674 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-3.01□□□□□ -2.89
DNF3Q12674 snR48snR48 113 nt-3.02□□□□□ -2.89
DNF3Q12674 YKL118WYKL118W 312 nt-3.03□□□□□ -2.89
DNF3Q12674 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-3.09□□□□□ -2.9
DNF3Q12674 snR6snR6 112 nt-3.11□□□□□ -2.91
DNF3Q12674 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-3.14□□□□□ -2.91
DNF3Q12674 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-3.17□□□□□ -2.92
DNF3Q12674 YJR162CYJR162C 351 nt-3.2□□□□□ -2.92
DNF3Q12674 YNL337WYNL337W 255 nt-3.2□□□□□ -2.92
DNF3Q12674 snR80snR80 171 nt-3.21□□□□□ -2.92
DNF3Q12674 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-3.22□□□□□ -2.92
DNF3Q12674 YJL150WYJL150W 303 nt-3.24□□□□□ -2.93
DNF3Q12674 RPL39YJL189W 156 nt-3.25□□□□□ -2.93
DNF3Q12674 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-3.25□□□□□ -2.93
DNF3Q12674 RPL41AYDL184C 78 nt-3.28□□□□□ -2.93
DNF3Q12674 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt-3.3□□□□□ -2.94
DNF3Q12674 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-3.3□□□□□ -2.94
DNF3Q12674 snR56snR56 88 nt-3.3□□□□□ -2.94
DNF3Q12674 YNL198CYNL198C 303 nt-3.3□□□□□ -2.94
DNF3Q12674 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-3.33□□□□□ -2.94
DNF3Q12674 snR73snR73 106 nt-3.36□□□□□ -2.95
DNF3Q12674 GIM4YEL003W 336 nt-3.37□□□□□ -2.95
DNF3Q12674 RPL41BYDL133C-A 78 nt-3.39□□□□□ -2.95
DNF3Q12674 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-3.4□□□□□ -2.95
DNF3Q12674 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-3.41□□□□□ -2.96
DNF3Q12674 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-3.41□□□□□ -2.96
DNF3Q12674 snR38snR38 95 nt-3.43□□□□□ -2.96
DNF3Q12674 YOR302WYOR302W 78 nt-3.44□□□□□ -2.96
DNF3Q12674 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-3.46□□□□□ -2.96
DNF3Q12674 snR52snR52 92 nt-3.52□□□□□ -2.97
DNF3Q12674 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-3.52□□□□□ -2.97
DNF3Q12674 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-3.54□□□□□ -2.98
DNF3Q12674 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-3.56□□□□□ -2.98
DNF3Q12674 SOM1YEL059C-A 225 nt-3.62□□□□□ -2.99
DNF3Q12674 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-3.63□□□□□ -2.99
DNF3Q12674 YDR157WYDR157W 402 nt-3.63□□□□□ -2.99
DNF3Q12674 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-3.75□□□□□ -3.01
DNF3Q12674 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-3.76□□□□□ -3.01
DNF3Q12674 snR85snR85 171 nt-3.79□□□□□ -3.02
DNF3Q12674 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-3.79□□□□□ -3.02
DNF3Q12674 YGR151CYGR151C 336 nt-3.83□□□□□ -3.02
DNF3Q12674 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-3.84□□□□□ -3.02
DNF3Q12674 snR47snR47 99 nt-3.86□□□□□ -3.03
DNF3Q12674 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-3.9□□□□□ -3.03
DNF3Q12674 snR87snR87 109 nt-3.91□□□□□ -3.04
DNF3Q12674 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-3.95□□□□□ -3.04
DNF3Q12674 snR65snR65 100 nt-4□□□□□ -3.05
DNF3Q12674 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-4.05□□□□□ -3.06
DNF3Q12674 Q0017Q0017 162 nt-4.07□□□□□ -3.06
DNF3Q12674 YKL225WYKL225W 348 nt-4.1□□□□□ -3.07
DNF3Q12674 YBL053WYBL053W 375 nt-4.1□□□□□ -3.07
DNF3Q12674 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-4.11□□□□□ -3.07
DNF3Q12674 snR58snR58 96 nt-4.21□□□□□ -3.08
DNF3Q12674 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-4.24□□□□□ -3.09
DNF3Q12674 SPG3YDR504C 384 nt-4.26□□□□□ -3.09
DNF3Q12674 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-4.27□□□□□ -3.09
DNF3Q12674 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-4.35□□□□□ -3.11
DNF3Q12674 VAR1Q0140 1197 nt-4.4□□□□□ -3.11
DNF3Q12674 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-4.48□□□□□ -3.13
DNF3Q12674 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-4.48□□□□□ -3.13
DNF3Q12674 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-4.55□□□□□ -3.14
DNF3Q12674 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-4.64□□□□□ -3.15
DNF3Q12674 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-4.64□□□□□ -3.15
DNF3Q12674 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-4.7□□□□□ -3.16
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