Protein–RNA interactions for Protein: Q12462

PEX11, Peroxisomal membrane protein PMP27, yeastyeast

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX11Q12462 snR67snR67 82 nt-1.71□□□□□ -2.68
PEX11Q12462 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-1.71□□□□□ -2.68
PEX11Q12462 snR39BsnR39B 96 nt-1.71□□□□□ -2.68
PEX11Q12462 YFL019CYFL019C 354 nt-1.73□□□□□ -2.69
PEX11Q12462 YEL014CYEL014C 306 nt-1.76□□□□□ -2.69
PEX11Q12462 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-1.78□□□□□ -2.69
PEX11Q12462 YER181CYER181C 324 nt-1.78□□□□□ -2.69
PEX11Q12462 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.78□□□□□ -2.69
PEX11Q12462 Q0017Q0017 162 nt-1.78□□□□□ -2.69
PEX11Q12462 YDR413CYDR413C 576 nt-1.79□□□□□ -2.7
PEX11Q12462 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-1.8□□□□□ -2.7
PEX11Q12462 RPL39YJL189W 156 nt-1.8□□□□□ -2.7
PEX11Q12462 YDR157WYDR157W 402 nt-1.81□□□□□ -2.7
PEX11Q12462 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.82□□□□□ -2.7
PEX11Q12462 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.83□□□□□ -2.7
PEX11Q12462 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-1.85□□□□□ -2.71
PEX11Q12462 YNL205CYNL205C 423 nt-1.85□□□□□ -2.71
PEX11Q12462 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-1.87□□□□□ -2.71
PEX11Q12462 snR77snR77 88 nt-1.88□□□□□ -2.71
PEX11Q12462 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-1.88□□□□□ -2.71
PEX11Q12462 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.9□□□□□ -2.71
PEX11Q12462 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt-1.92□□□□□ -2.72
PEX11Q12462 YBR178WYBR178W 375 nt-1.92□□□□□ -2.72
PEX11Q12462 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-1.93□□□□□ -2.72
PEX11Q12462 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-1.94□□□□□ -2.72
PEX11Q12462 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.95□□□□□ -2.72
PEX11Q12462 snR81snR81 201 nt-1.99□□□□□ -2.73
PEX11Q12462 YKL118WYKL118W 312 nt-1.99□□□□□ -2.73
PEX11Q12462 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-1.99□□□□□ -2.73
PEX11Q12462 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-2□□□□□ -2.73
PEX11Q12462 snR55snR55 98 nt-2.01□□□□□ -2.73
PEX11Q12462 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-2.02□□□□□ -2.73
PEX11Q12462 snR48snR48 113 nt-2.06□□□□□ -2.74
PEX11Q12462 GIM4YEL003W 336 nt-2.08□□□□□ -2.74
PEX11Q12462 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.15□□□□□ -2.75
PEX11Q12462 YOR102WYOR102W 351 nt-2.16□□□□□ -2.76
PEX11Q12462 YPR012WYPR012W 255 nt-2.16□□□□□ -2.76
PEX11Q12462 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-2.17□□□□□ -2.76
PEX11Q12462 VAR1Q0140 1197 nt-2.19□□□□□ -2.76
PEX11Q12462 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-2.19□□□□□ -2.76
PEX11Q12462 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-2.21□□□□□ -2.76
PEX11Q12462 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-2.22□□□□□ -2.76
PEX11Q12462 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-2.23□□□□□ -2.77
PEX11Q12462 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-2.24□□□□□ -2.77
PEX11Q12462 YOR302WYOR302W 78 nt-2.25□□□□□ -2.77
PEX11Q12462 YOR309CYOR309C 381 nt-2.36□□□□□ -2.79
PEX11Q12462 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-2.36□□□□□ -2.79
PEX11Q12462 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-2.37□□□□□ -2.79
PEX11Q12462 snR65snR65 100 nt-2.4□□□□□ -2.79
PEX11Q12462 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-2.41□□□□□ -2.8
PEX11Q12462 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-2.42□□□□□ -2.8
PEX11Q12462 snR52snR52 92 nt-2.42□□□□□ -2.8
PEX11Q12462 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-2.43□□□□□ -2.8
PEX11Q12462 YDR543CYDR543C 300 nt-2.51□□□□□ -2.81
PEX11Q12462 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-2.51□□□□□ -2.81
PEX11Q12462 YNL198CYNL198C 303 nt-2.56□□□□□ -2.82
PEX11Q12462 YJL150WYJL150W 303 nt-2.59□□□□□ -2.82
PEX11Q12462 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-2.7□□□□□ -2.84
PEX11Q12462 snR56snR56 88 nt-2.72□□□□□ -2.84
PEX11Q12462 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-2.72□□□□□ -2.84
PEX11Q12462 snR80snR80 171 nt-2.76□□□□□ -2.85
PEX11Q12462 SOM1YEL059C-A 225 nt-2.77□□□□□ -2.85
PEX11Q12462 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-2.79□□□□□ -2.86
PEX11Q12462 snR6snR6 112 nt-2.81□□□□□ -2.86
PEX11Q12462 RPL41AYDL184C 78 nt-2.82□□□□□ -2.86
PEX11Q12462 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.82□□□□□ -2.86
PEX11Q12462 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-2.83□□□□□ -2.86
PEX11Q12462 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-2.83□□□□□ -2.86
PEX11Q12462 Q0144Q0144 330 nt-2.85□□□□□ -2.87
PEX11Q12462 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-2.86□□□□□ -2.87
PEX11Q12462 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-2.87□□□□□ -2.87
PEX11Q12462 snR38snR38 95 nt-2.89□□□□□ -2.87
PEX11Q12462 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-2.91□□□□□ -2.88
PEX11Q12462 Q0142Q0142 177 nt-2.93□□□□□ -2.88
PEX11Q12462 YBL053WYBL053W 375 nt-2.95□□□□□ -2.88
PEX11Q12462 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.96□□□□□ -2.88
PEX11Q12462 snR73snR73 106 nt-2.99□□□□□ -2.89
PEX11Q12462 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-3□□□□□ -2.89
PEX11Q12462 RPL41BYDL133C-A 78 nt-3.07□□□□□ -2.9
PEX11Q12462 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-3.07□□□□□ -2.9
PEX11Q12462 YGR151CYGR151C 336 nt-3.09□□□□□ -2.9
PEX11Q12462 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-3.12□□□□□ -2.91
PEX11Q12462 snR47snR47 99 nt-3.2□□□□□ -2.92
PEX11Q12462 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-3.32□□□□□ -2.94
PEX11Q12462 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-3.36□□□□□ -2.95
PEX11Q12462 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-3.36□□□□□ -2.95
PEX11Q12462 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-3.38□□□□□ -2.95
PEX11Q12462 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-3.38□□□□□ -2.95
PEX11Q12462 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-3.4□□□□□ -2.95
PEX11Q12462 snR85snR85 171 nt-3.43□□□□□ -2.96
PEX11Q12462 YKL225WYKL225W 348 nt-3.46□□□□□ -2.96
PEX11Q12462 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-3.5□□□□□ -2.97
PEX11Q12462 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-3.5□□□□□ -2.97
PEX11Q12462 SPG3YDR504C 384 nt-3.54□□□□□ -2.98
PEX11Q12462 YJR162CYJR162C 351 nt-3.63□□□□□ -2.99
PEX11Q12462 YNL337WYNL337W 255 nt-3.63□□□□□ -2.99
PEX11Q12462 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-3.78□□□□□ -3.01
PEX11Q12462 snR87snR87 109 nt-3.79□□□□□ -3.02
PEX11Q12462 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-3.83□□□□□ -3.02
PEX11Q12462 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-3.84□□□□□ -3.02
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