Protein–RNA interactions for Protein: Q12454

OCA6, Putative tyrosine-protein phosphatase OCA6, yeast

Predictions only

Length 224 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OCA6	Q12454	YAL063C-A	YAL063C-A	291 nt		-1.7	□□□□□ -2.68
OCA6	Q12454	YOR008C-A	YOR008C-A	225 nt		-1.7	□□□□□ -2.68
OCA6	Q12454	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-1.71	□□□□□ -2.68
OCA6	Q12454	YAL068W-A	YAL068W-A	255 nt		-1.72	□□□□□ -2.68
OCA6	Q12454	snR81	snR81	201 nt		-1.73	□□□□□ -2.69
OCA6	Q12454	YEL014C	YEL014C	306 nt		-1.73	□□□□□ -2.69
OCA6	Q12454	YDR183C-A	YDR183C-A	258 nt		-1.76	□□□□□ -2.69
OCA6	Q12454	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-1.76	□□□□□ -2.69
OCA6	Q12454	YBR182C-A	YBR182C-A	195 nt		-1.78	□□□□□ -2.69
OCA6	Q12454	YOR293C-A	YOR293C-A	150 nt		-1.79	□□□□□ -2.7
OCA6	Q12454	YBR178W	YBR178W	375 nt		-1.8	□□□□□ -2.7
OCA6	Q12454	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
OCA6	Q12454	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
OCA6	Q12454	YEL050W-A	YEL050W-A	192 nt		-1.82	□□□□□ -2.7
OCA6	Q12454	YAL016C-B	YAL016C-B	186 nt		-1.88	□□□□□ -2.71
OCA6	Q12454	YBR131C-A	YBR131C-A	90 nt		-1.88	□□□□□ -2.71
OCA6	Q12454	tF(GAA)Q	tF(GAA)Q	75 nt		-1.89	□□□□□ -2.71
OCA6	Q12454	YJR157W	YJR157W	363 nt		-1.89	□□□□□ -2.71
OCA6	Q12454	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-1.91	□□□□□ -2.72
OCA6	Q12454	YER181C	YER181C	324 nt		-1.93	□□□□□ -2.72
OCA6	Q12454	YPL038W-A	YPL038W-A	192 nt		-1.96	□□□□□ -2.72
OCA6	Q12454	YPR197C	YPR197C	564 nt		-1.97	□□□□□ -2.72
OCA6	Q12454	YLR222C-A	YLR222C-A	231 nt		-1.99	□□□□□ -2.73
OCA6	Q12454	YDR413C	YDR413C	576 nt		-2	□□□□□ -2.73
OCA6	Q12454	YOR309C	YOR309C	381 nt		-2	□□□□□ -2.73
OCA6	Q12454	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-2	□□□□□ -2.73
OCA6	Q12454	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-2.01	□□□□□ -2.73
OCA6	Q12454	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		-2.02	□□□□□ -2.73
OCA6	Q12454	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-2.06	□□□□□ -2.74
OCA6	Q12454	snR48	snR48	113 nt		-2.07	□□□□□ -2.74
OCA6	Q12454	RPL39	YJL189W	156 nt		-2.09	□□□□□ -2.74
OCA6	Q12454	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		-2.09	□□□□□ -2.74
OCA6	Q12454	YOR102W	YOR102W	351 nt		-2.11	□□□□□ -2.75
OCA6	Q12454	snR55	snR55	98 nt		-2.13	□□□□□ -2.75
OCA6	Q12454	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-2.13	□□□□□ -2.75
OCA6	Q12454	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-2.14	□□□□□ -2.75
OCA6	Q12454	YKL118W	YKL118W	312 nt		-2.16	□□□□□ -2.76
OCA6	Q12454	YDR157W	YDR157W	402 nt		-2.21	□□□□□ -2.76
OCA6	Q12454	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-2.21	□□□□□ -2.76
OCA6	Q12454	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-2.22	□□□□□ -2.76
OCA6	Q12454	YDL240C-A	YDL240C-A	138 nt		-2.24	□□□□□ -2.77
OCA6	Q12454	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-2.24	□□□□□ -2.77
OCA6	Q12454	YOR302W	YOR302W	78 nt		-2.26	□□□□□ -2.77
OCA6	Q12454	YPR012W	YPR012W	255 nt		-2.29	□□□□□ -2.78
OCA6	Q12454	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-2.31	□□□□□ -2.78
OCA6	Q12454	YOL155W-A	YOL155W-A	135 nt		-2.32	□□□□□ -2.78
OCA6	Q12454	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		-2.34	□□□□□ -2.78
OCA6	Q12454	YDR118W-A	YDR118W-A	117 nt		-2.35	□□□□□ -2.79
OCA6	Q12454	GIM4	YEL003W	336 nt		-2.36	□□□□□ -2.79
OCA6	Q12454	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-2.36	□□□□□ -2.79
OCA6	Q12454	snR52	snR52	92 nt		-2.37	□□□□□ -2.79
OCA6	Q12454	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-2.38	□□□□□ -2.79
OCA6	Q12454	YJL150W	YJL150W	303 nt		-2.38	□□□□□ -2.79
OCA6	Q12454	Q0017	Q0017	162 nt		-2.42	□□□□□ -2.8
OCA6	Q12454	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-2.46	□□□□□ -2.8
OCA6	Q12454	YNL198C	YNL198C	303 nt		-2.47	□□□□□ -2.8
OCA6	Q12454	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		-2.47	□□□□□ -2.8
OCA6	Q12454	snR6	snR6	112 nt		-2.48	□□□□□ -2.81
OCA6	Q12454	YDR543C	YDR543C	300 nt		-2.49	□□□□□ -2.81
OCA6	Q12454	snR56	snR56	88 nt		-2.54	□□□□□ -2.82
OCA6	Q12454	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-2.57	□□□□□ -2.82
OCA6	Q12454	snR65	snR65	100 nt		-2.58	□□□□□ -2.82
OCA6	Q12454	RPL41A	YDL184C	78 nt		-2.6	□□□□□ -2.83
OCA6	Q12454	VAR1	Q0140	1197 nt		-2.61	□□□□□ -2.83
OCA6	Q12454	snR73	snR73	106 nt		-2.62	□□□□□ -2.83
OCA6	Q12454	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-2.62	□□□□□ -2.83
OCA6	Q12454	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-2.62	□□□□□ -2.83
OCA6	Q12454	snR38	snR38	95 nt		-2.64	□□□□□ -2.83
OCA6	Q12454	snR80	snR80	171 nt		-2.67	□□□□□ -2.84
OCA6	Q12454	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-2.75	□□□□□ -2.85
OCA6	Q12454	YBL053W	YBL053W	375 nt		-2.75	□□□□□ -2.85
OCA6	Q12454	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-2.78	□□□□□ -2.85
OCA6	Q12454	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-2.82	□□□□□ -2.86
OCA6	Q12454	YGR151C	YGR151C	336 nt		-2.87	□□□□□ -2.87
OCA6	Q12454	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-2.88	□□□□□ -2.87
OCA6	Q12454	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-2.89	□□□□□ -2.87
OCA6	Q12454	YDR524C-A	YDR524C-A	120 nt		-2.89	□□□□□ -2.87
OCA6	Q12454	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		-2.93	□□□□□ -2.88
OCA6	Q12454	snR47	snR47	99 nt		-2.97	□□□□□ -2.88
OCA6	Q12454	Q0142	Q0142	177 nt		-3	□□□□□ -2.89
OCA6	Q12454	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-3.05	□□□□□ -2.9
OCA6	Q12454	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-3.06	□□□□□ -2.9
OCA6	Q12454	YOL166W-A	YOL166W-A	156 nt		-3.06	□□□□□ -2.9
OCA6	Q12454	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-3.1	□□□□□ -2.91
OCA6	Q12454	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		-3.12	□□□□□ -2.91
OCA6	Q12454	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-3.12	□□□□□ -2.91
OCA6	Q12454	snR85	snR85	171 nt		-3.14	□□□□□ -2.91
OCA6	Q12454	YKL225W	YKL225W	348 nt		-3.18	□□□□□ -2.92
OCA6	Q12454	tR(ACG)Q2	tR(ACG)Q2	74 nt		-3.24	□□□□□ -2.93
OCA6	Q12454	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-3.24	□□□□□ -2.93
OCA6	Q12454	snR87	snR87	109 nt		-3.25	□□□□□ -2.93
OCA6	Q12454	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-3.25	□□□□□ -2.93
OCA6	Q12454	SPG3	YDR504C	384 nt		-3.26	□□□□□ -2.93
OCA6	Q12454	YNL337W	YNL337W	255 nt		-3.33	□□□□□ -2.94
OCA6	Q12454	YJR162C	YJR162C	351 nt		-3.4	□□□□□ -2.95
OCA6	Q12454	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-3.4	□□□□□ -2.95
OCA6	Q12454	Q0144	Q0144	330 nt		-3.42	□□□□□ -2.96
OCA6	Q12454	YKL096C-B	YKL096C-B	150 nt		-3.53	□□□□□ -2.97
OCA6	Q12454	YGR122C-A	YGR122C-A	129 nt		-3.54	□□□□□ -2.98
OCA6	Q12454	YDL159W-A	YDL159W-A	132 nt		-3.55	□□□□□ -2.98

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