Protein–RNA interactions for Protein: Q12429

DPH6, Diphthine--ammonia ligase, yeastyeast

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPH6Q12429 BUL2YML111W 2763 nt1.73□□□□□ -2.13
DPH6Q12429 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.73□□□□□ -2.13
DPH6Q12429 SEC3YER008C 4011 nt1.73□□□□□ -2.13
DPH6Q12429 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt1.72□□□□□ -2.13
DPH6Q12429 APL3YBL037W 3078 nt1.7□□□□□ -2.14
DPH6Q12429 LAA1YJL207C 6045 nt1.7□□□□□ -2.14
DPH6Q12429 BST1YFL025C 3090 nt1.69□□□□□ -2.14
DPH6Q12429 SSK2YNR031C 4740 nt1.68□□□□□ -2.14
DPH6Q12429 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.68□□□□□ -2.14
DPH6Q12429 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.65□□□□□ -2.14
DPH6Q12429 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.65□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 VPS15YBR097W 4365 nt1.65□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 CDC39YCR093W 6327 nt1.64□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 NUP188YML103C 4968 nt1.64□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 IML1YJR138W 4755 nt1.64□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 CLU1YMR012W 3834 nt1.64□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.63□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.63□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.63□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.63□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.63□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.63□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.63□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 SPC110YDR356W 2835 nt1.62□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 MSN5YDR335W 3675 nt1.62□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 SWI4YER111C 3282 nt1.62□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 IRA1YBR140C 9279 nt1.61□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 FYV8YGR196C 2454 nt1.6□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt1.59□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.59□□□□□ -2.15
DPH6Q12429 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.57□□□□□ -2.16
DPH6Q12429 CDC25YLR310C 4770 nt1.56□□□□□ -2.16
DPH6Q12429 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt1.54□□□□□ -2.16
DPH6Q12429 BUD3YCL014W 4911 nt1.54□□□□□ -2.16
DPH6Q12429 snR40snR40 97 nt1.53□□□□□ -2.16
DPH6Q12429 NUP145YGL092W 3954 nt1.52□□□□□ -2.17
DPH6Q12429 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.49□□□□□ -2.17
DPH6Q12429 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.49□□□□□ -2.17
DPH6Q12429 HKR1YDR420W 5409 nt1.49□□□□□ -2.17
DPH6Q12429 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.47□□□□□ -2.17
DPH6Q12429 snR67snR67 82 nt1.44□□□□□ -2.18
DPH6Q12429 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt1.43□□□□□ -2.18
DPH6Q12429 SPT7YBR081C 3999 nt1.39□□□□□ -2.19
DPH6Q12429 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.37□□□□□ -2.19
DPH6Q12429 YMR160WYMR160W 2451 nt1.35□□□□□ -2.19
DPH6Q12429 RKR1YMR247C 4689 nt1.34□□□□□ -2.2
DPH6Q12429 VAM6YDL077C 3150 nt1.32□□□□□ -2.2
DPH6Q12429 PAU24YBR301W 363 nt1.32□□□□□ -2.2
DPH6Q12429 MLP2YIL149C 5040 nt1.29□□□□□ -2.2
DPH6Q12429 DOP1YDR141C 5097 nt1.27□□□□□ -2.21
DPH6Q12429 YPR117WYPR117W 7470 nt1.22□□□□□ -2.21
DPH6Q12429 YJR029WYJR029W 5268 nt1.17□□□□□ -2.22
DPH6Q12429 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.17□□□□□ -2.22
DPH6Q12429 THO2YNL139C 4794 nt1.16□□□□□ -2.22
DPH6Q12429 snR77snR77 88 nt1.16□□□□□ -2.22
DPH6Q12429 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.16□□□□□ -2.22
DPH6Q12429 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.16□□□□□ -2.22
DPH6Q12429 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.16□□□□□ -2.22
DPH6Q12429 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.16□□□□□ -2.22
DPH6Q12429 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.16□□□□□ -2.22
DPH6Q12429 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.16□□□□□ -2.22
DPH6Q12429 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.16□□□□□ -2.22
DPH6Q12429 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.16□□□□□ -2.22
DPH6Q12429 UTP20YBL004W 7482 nt1.13□□□□□ -2.23
DPH6Q12429 SOV1YMR066W 2697 nt1.09□□□□□ -2.23
DPH6Q12429 SCC2YDR180W 4482 nt1.08□□□□□ -2.24
DPH6Q12429 BEM2YER155C 6504 nt1.07□□□□□ -2.24
DPH6Q12429 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.07□□□□□ -2.24
DPH6Q12429 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.07□□□□□ -2.24
DPH6Q12429 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.07□□□□□ -2.24
DPH6Q12429 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.07□□□□□ -2.24
DPH6Q12429 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.07□□□□□ -2.24
DPH6Q12429 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt1.07□□□□□ -2.24
DPH6Q12429 LTE1YAL024C 4308 nt1.05□□□□□ -2.24
DPH6Q12429 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.03□□□□□ -2.24
DPH6Q12429 SBH2YER019C-A 267 nt0.99□□□□□ -2.25
DPH6Q12429 YOL014WYOL014W 375 nt0.96□□□□□ -2.26
DPH6Q12429 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.95□□□□□ -2.26
DPH6Q12429 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.9□□□□□ -2.27
DPH6Q12429 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.9□□□□□ -2.27
DPH6Q12429 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.9□□□□□ -2.27
DPH6Q12429 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.9□□□□□ -2.27
DPH6Q12429 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
DPH6Q12429 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
DPH6Q12429 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.9□□□□□ -2.27
DPH6Q12429 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
DPH6Q12429 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
DPH6Q12429 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
DPH6Q12429 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
DPH6Q12429 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.87□□□□□ -2.27
DPH6Q12429 IQG1YPL242C 4488 nt0.84□□□□□ -2.27
DPH6Q12429 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.81□□□□□ -2.28
DPH6Q12429 ESP1YGR098C 4893 nt0.74□□□□□ -2.29
DPH6Q12429 FMP27YLR454W 7887 nt0.73□□□□□ -2.29
DPH6Q12429 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.71□□□□□ -2.3
DPH6Q12429 MLP1YKR095W 5628 nt0.7□□□□□ -2.3
DPH6Q12429 PAU9YBL108C-A 129 nt0.69□□□□□ -2.3
DPH6Q12429 UTP10YJL109C 5310 nt0.67□□□□□ -2.3
DPH6Q12429 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.64□□□□□ -2.31
DPH6Q12429 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt0.61□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 93 ms