Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 YNL122CYNL122C 348 nt-2.38□□□□□ -2.79
TY1B-BRQ12193 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-2.39□□□□□ -2.79
TY1B-BRQ12193 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-2.4□□□□□ -2.79
TY1B-BRQ12193 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-2.4□□□□□ -2.79
TY1B-BRQ12193 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-2.41□□□□□ -2.79
TY1B-BRQ12193 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-2.42□□□□□ -2.8
TY1B-BRQ12193 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-2.42□□□□□ -2.8
TY1B-BRQ12193 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-2.43□□□□□ -2.8
TY1B-BRQ12193 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-2.44□□□□□ -2.8
TY1B-BRQ12193 HTL1YCR020W-B 237 nt-2.45□□□□□ -2.8
TY1B-BRQ12193 YJR157WYJR157W 363 nt-2.45□□□□□ -2.8
TY1B-BRQ12193 BIL1YOR304C-A 231 nt-2.46□□□□□ -2.8
TY1B-BRQ12193 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-2.48□□□□□ -2.81
TY1B-BRQ12193 YPR197CYPR197C 564 nt-2.48□□□□□ -2.81
TY1B-BRQ12193 YEL014CYEL014C 306 nt-2.53□□□□□ -2.81
TY1B-BRQ12193 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-2.54□□□□□ -2.82
TY1B-BRQ12193 YGL041CYGL041C 204 nt-2.54□□□□□ -2.82
TY1B-BRQ12193 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-2.55□□□□□ -2.82
TY1B-BRQ12193 YBR178WYBR178W 375 nt-2.55□□□□□ -2.82
TY1B-BRQ12193 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-2.56□□□□□ -2.82
TY1B-BRQ12193 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-2.56□□□□□ -2.82
TY1B-BRQ12193 ATP19YOL077W-A 207 nt-2.61□□□□□ -2.83
TY1B-BRQ12193 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt-2.63□□□□□ -2.83
TY1B-BRQ12193 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-2.64□□□□□ -2.83
TY1B-BRQ12193 snR78snR78 87 nt-2.64□□□□□ -2.83
TY1B-BRQ12193 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-2.7□□□□□ -2.84
TY1B-BRQ12193 YDR413CYDR413C 576 nt-2.73□□□□□ -2.85
TY1B-BRQ12193 YER181CYER181C 324 nt-2.74□□□□□ -2.85
TY1B-BRQ12193 snR55snR55 98 nt-2.77□□□□□ -2.85
TY1B-BRQ12193 YGR035CYGR035C 351 nt-2.78□□□□□ -2.85
TY1B-BRQ12193 YNR025CYNR025C 360 nt-2.79□□□□□ -2.86
TY1B-BRQ12193 YOR102WYOR102W 351 nt-2.81□□□□□ -2.86
TY1B-BRQ12193 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-2.83□□□□□ -2.86
TY1B-BRQ12193 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-2.84□□□□□ -2.86
TY1B-BRQ12193 YKL118WYKL118W 312 nt-2.85□□□□□ -2.87
TY1B-BRQ12193 snR80snR80 171 nt-2.87□□□□□ -2.87
TY1B-BRQ12193 YJR162CYJR162C 351 nt-2.87□□□□□ -2.87
TY1B-BRQ12193 YNL337WYNL337W 255 nt-2.87□□□□□ -2.87
TY1B-BRQ12193 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt-2.88□□□□□ -2.87
TY1B-BRQ12193 YPR012WYPR012W 255 nt-2.89□□□□□ -2.87
TY1B-BRQ12193 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-2.92□□□□□ -2.88
TY1B-BRQ12193 snR6snR6 112 nt-2.93□□□□□ -2.88
TY1B-BRQ12193 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-2.98□□□□□ -2.89
TY1B-BRQ12193 snR48snR48 113 nt-3□□□□□ -2.89
TY1B-BRQ12193 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-3.01□□□□□ -2.89
TY1B-BRQ12193 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-3.02□□□□□ -2.89
TY1B-BRQ12193 RPL41AYDL184C 78 nt-3.07□□□□□ -2.9
TY1B-BRQ12193 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-3.07□□□□□ -2.9
TY1B-BRQ12193 YJL150WYJL150W 303 nt-3.08□□□□□ -2.9
TY1B-BRQ12193 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-3.08□□□□□ -2.9
TY1B-BRQ12193 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt-3.1□□□□□ -2.91
TY1B-BRQ12193 YNL198CYNL198C 303 nt-3.1□□□□□ -2.91
TY1B-BRQ12193 snR73snR73 106 nt-3.11□□□□□ -2.91
TY1B-BRQ12193 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-3.11□□□□□ -2.91
TY1B-BRQ12193 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-3.13□□□□□ -2.91
TY1B-BRQ12193 RPL39YJL189W 156 nt-3.16□□□□□ -2.92
TY1B-BRQ12193 snR56snR56 88 nt-3.2□□□□□ -2.92
TY1B-BRQ12193 RPL41BYDL133C-A 78 nt-3.2□□□□□ -2.92
TY1B-BRQ12193 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-3.2□□□□□ -2.92
TY1B-BRQ12193 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-3.21□□□□□ -2.92
TY1B-BRQ12193 GIM4YEL003W 336 nt-3.23□□□□□ -2.93
TY1B-BRQ12193 snR38snR38 95 nt-3.23□□□□□ -2.93
TY1B-BRQ12193 YOR302WYOR302W 78 nt-3.28□□□□□ -2.93
TY1B-BRQ12193 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-3.34□□□□□ -2.94
TY1B-BRQ12193 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-3.34□□□□□ -2.94
TY1B-BRQ12193 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-3.36□□□□□ -2.95
TY1B-BRQ12193 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-3.38□□□□□ -2.95
TY1B-BRQ12193 snR52snR52 92 nt-3.42□□□□□ -2.96
TY1B-BRQ12193 YDR157WYDR157W 402 nt-3.43□□□□□ -2.96
TY1B-BRQ12193 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-3.43□□□□□ -2.96
TY1B-BRQ12193 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-3.48□□□□□ -2.97
TY1B-BRQ12193 SOM1YEL059C-A 225 nt-3.48□□□□□ -2.97
TY1B-BRQ12193 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-3.53□□□□□ -2.98
TY1B-BRQ12193 snR87snR87 109 nt-3.54□□□□□ -2.98
TY1B-BRQ12193 snR85snR85 171 nt-3.61□□□□□ -2.99
TY1B-BRQ12193 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-3.61□□□□□ -2.99
TY1B-BRQ12193 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-3.62□□□□□ -2.99
TY1B-BRQ12193 YGR151CYGR151C 336 nt-3.64□□□□□ -2.99
TY1B-BRQ12193 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-3.65□□□□□ -2.99
TY1B-BRQ12193 snR47snR47 99 nt-3.66□□□□□ -2.99
TY1B-BRQ12193 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-3.8□□□□□ -3.02
TY1B-BRQ12193 snR58snR58 96 nt-3.81□□□□□ -3.02
TY1B-BRQ12193 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-3.81□□□□□ -3.02
TY1B-BRQ12193 snR65snR65 100 nt-3.85□□□□□ -3.03
TY1B-BRQ12193 Q0017Q0017 162 nt-3.86□□□□□ -3.03
TY1B-BRQ12193 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-3.91□□□□□ -3.03
TY1B-BRQ12193 YBL053WYBL053W 375 nt-3.94□□□□□ -3.04
TY1B-BRQ12193 YKL225WYKL225W 348 nt-3.94□□□□□ -3.04
TY1B-BRQ12193 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-4.02□□□□□ -3.05
TY1B-BRQ12193 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-4.02□□□□□ -3.05
TY1B-BRQ12193 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-4.03□□□□□ -3.05
TY1B-BRQ12193 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-4.05□□□□□ -3.06
TY1B-BRQ12193 SPG3YDR504C 384 nt-4.09□□□□□ -3.06
TY1B-BRQ12193 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-4.09□□□□□ -3.06
TY1B-BRQ12193 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-4.16□□□□□ -3.08
TY1B-BRQ12193 VAR1Q0140 1197 nt-4.2□□□□□ -3.08
TY1B-BRQ12193 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-4.2□□□□□ -3.08
TY1B-BRQ12193 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-4.41□□□□□ -3.12
TY1B-BRQ12193 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-4.42□□□□□ -3.12
TY1B-BRQ12193 YNL170WYNL170W 396 nt-4.5□□□□□ -3.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms