Protein–RNA interactions for Protein: Q12150

CSF1, Protein CSF1, yeastyeast

Predictions only

Length 2,958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSF1Q12150 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-3.17□□□□□ -2.92
CSF1Q12150 TSC3YBR058C-A 243 nt-3.17□□□□□ -2.92
CSF1Q12150 Q0255Q0255 1419 nt-3.17□□□□□ -2.92
CSF1Q12150 YAR047CYAR047C 321 nt-3.18□□□□□ -2.92
CSF1Q12150 YBL071CYBL071C 309 nt-3.18□□□□□ -2.92
CSF1Q12150 ATG16YMR159C 453 nt-3.2□□□□□ -2.92
CSF1Q12150 YPR012WYPR012W 255 nt-3.24□□□□□ -2.93
CSF1Q12150 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-3.27□□□□□ -2.93
CSF1Q12150 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-3.29□□□□□ -2.94
CSF1Q12150 YFL019CYFL019C 354 nt-3.29□□□□□ -2.94
CSF1Q12150 snR41snR41 95 nt-3.31□□□□□ -2.94
CSF1Q12150 YDL016CYDL016C 303 nt-3.32□□□□□ -2.94
CSF1Q12150 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-3.32□□□□□ -2.94
CSF1Q12150 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt-3.32□□□□□ -2.94
CSF1Q12150 YBR178WYBR178W 375 nt-3.32□□□□□ -2.94
CSF1Q12150 ATP6Q0085 780 nt-3.35□□□□□ -2.95
CSF1Q12150 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-3.35□□□□□ -2.95
CSF1Q12150 Q0143Q0143 153 nt-3.41□□□□□ -2.96
CSF1Q12150 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-3.41□□□□□ -2.96
CSF1Q12150 YJR157WYJR157W 363 nt-3.45□□□□□ -2.96
CSF1Q12150 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-3.47□□□□□ -2.97
CSF1Q12150 YFL032WYFL032W 321 nt-3.52□□□□□ -2.97
CSF1Q12150 YDR413CYDR413C 576 nt-3.52□□□□□ -2.97
CSF1Q12150 YGR035CYGR035C 351 nt-3.56□□□□□ -2.98
CSF1Q12150 CSN9YDR179C 489 nt-3.62□□□□□ -2.99
CSF1Q12150 snR78snR78 87 nt-3.67□□□□□ -3
CSF1Q12150 RPL41AYDL184C 78 nt-3.7□□□□□ -3
CSF1Q12150 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-3.72□□□□□ -3.01
CSF1Q12150 snR60snR60 104 nt-3.75□□□□□ -3.01
CSF1Q12150 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-3.78□□□□□ -3.02
CSF1Q12150 YGL041CYGL041C 204 nt-3.79□□□□□ -3.02
CSF1Q12150 snR54snR54 86 nt-3.83□□□□□ -3.02
CSF1Q12150 YEL014CYEL014C 306 nt-3.84□□□□□ -3.02
CSF1Q12150 snR58snR58 96 nt-3.86□□□□□ -3.03
CSF1Q12150 YNL028WYNL028W 318 nt-3.86□□□□□ -3.03
CSF1Q12150 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-3.87□□□□□ -3.03
CSF1Q12150 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-3.87□□□□□ -3.03
CSF1Q12150 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt-3.92□□□□□ -3.04
CSF1Q12150 YKL118WYKL118W 312 nt-3.96□□□□□ -3.04
CSF1Q12150 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-3.97□□□□□ -3.04
CSF1Q12150 YOR102WYOR102W 351 nt-3.99□□□□□ -3.05
CSF1Q12150 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-3.99□□□□□ -3.05
CSF1Q12150 RPL39YJL189W 156 nt-4□□□□□ -3.05
CSF1Q12150 YNL324WYNL324W 396 nt-4.01□□□□□ -3.05
CSF1Q12150 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-4.02□□□□□ -3.05
CSF1Q12150 YDR157WYDR157W 402 nt-4.02□□□□□ -3.05
CSF1Q12150 YER006C-AYER006C-A 318 nt-4.02□□□□□ -3.05
CSF1Q12150 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-4.02□□□□□ -3.05
CSF1Q12150 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-4.04□□□□□ -3.06
CSF1Q12150 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-4.05□□□□□ -3.06
CSF1Q12150 YLR434CYLR434C 384 nt-4.05□□□□□ -3.06
CSF1Q12150 snR38snR38 95 nt-4.07□□□□□ -3.06
CSF1Q12150 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-4.07□□□□□ -3.06
CSF1Q12150 YNL122CYNL122C 348 nt-4.1□□□□□ -3.07
CSF1Q12150 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-4.11□□□□□ -3.07
CSF1Q12150 AI5_BETAQ0075 1065 nt-4.11□□□□□ -3.07
CSF1Q12150 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-4.11□□□□□ -3.07
CSF1Q12150 GIM4YEL003W 336 nt-4.14□□□□□ -3.07
CSF1Q12150 snR85snR85 171 nt-4.16□□□□□ -3.07
CSF1Q12150 HTL1YCR020W-B 237 nt-4.16□□□□□ -3.08
CSF1Q12150 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-4.17□□□□□ -3.08
CSF1Q12150 snR56snR56 88 nt-4.18□□□□□ -3.08
CSF1Q12150 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-4.18□□□□□ -3.08
CSF1Q12150 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-4.18□□□□□ -3.08
CSF1Q12150 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-4.2□□□□□ -3.08
CSF1Q12150 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-4.26□□□□□ -3.09
CSF1Q12150 snR48snR48 113 nt-4.26□□□□□ -3.09
CSF1Q12150 snR34snR34 203 nt-4.29□□□□□ -3.1
CSF1Q12150 YGR151CYGR151C 336 nt-4.31□□□□□ -3.1
CSF1Q12150 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-4.35□□□□□ -3.11
CSF1Q12150 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt-4.43□□□□□ -3.12
CSF1Q12150 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-4.48□□□□□ -3.13
CSF1Q12150 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-4.49□□□□□ -3.13
CSF1Q12150 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-4.57□□□□□ -3.14
CSF1Q12150 YKL123WYKL123W 381 nt-4.58□□□□□ -3.14
CSF1Q12150 YBL053WYBL053W 375 nt-4.58□□□□□ -3.14
CSF1Q12150 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-4.6□□□□□ -3.15
CSF1Q12150 snR47snR47 99 nt-4.61□□□□□ -3.15
CSF1Q12150 SOM1YEL059C-A 225 nt-4.65□□□□□ -3.15
CSF1Q12150 SPG3YDR504C 384 nt-4.72□□□□□ -3.17
CSF1Q12150 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-4.73□□□□□ -3.17
CSF1Q12150 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-4.8□□□□□ -3.18
CSF1Q12150 YKL225WYKL225W 348 nt-4.82□□□□□ -3.18
CSF1Q12150 YAL066WYAL066W 309 nt-4.86□□□□□ -3.19
CSF1Q12150 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-4.87□□□□□ -3.19
CSF1Q12150 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-4.87□□□□□ -3.19
CSF1Q12150 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt-4.9□□□□□ -3.19
CSF1Q12150 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-4.91□□□□□ -3.19
CSF1Q12150 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-4.94□□□□□ -3.2
CSF1Q12150 snR52snR52 92 nt-4.94□□□□□ -3.2
CSF1Q12150 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-5.02□□□□□ -3.21
CSF1Q12150 YOR302WYOR302W 78 nt-5.04□□□□□ -3.22
CSF1Q12150 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-5.09□□□□□ -3.22
CSF1Q12150 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-5.25□□□□□ -3.25
CSF1Q12150 snR40snR40 97 nt-5.33□□□□□ -3.26
CSF1Q12150 YOR225WYOR225W 330 nt-5.33□□□□□ -3.26
CSF1Q12150 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt-5.39□□□□□ -3.27
CSF1Q12150 YNR025CYNR025C 360 nt-5.45□□□□□ -3.28
CSF1Q12150 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-5.46□□□□□ -3.28
CSF1Q12150 snR64snR64 101 nt-5.7□□□□□ -3.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 498.1 ms