Protein–RNA interactions for Protein: Q12026

YLR053C, Putative uncharacterized protein YLR053C, yeast

Predictions only

Length 108 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR053C	Q12026	YBR182C-A	YBR182C-A	195 nt		-1.97	□□□□□ -2.72
YLR053C	Q12026	YEL014C	YEL014C	306 nt		-1.99	□□□□□ -2.73
YLR053C	Q12026	YAL016C-B	YAL016C-B	186 nt		-2.02	□□□□□ -2.73
YLR053C	Q12026	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-2.05	□□□□□ -2.74
YLR053C	Q12026	YOR008C-A	YOR008C-A	225 nt		-2.07	□□□□□ -2.74
YLR053C	Q12026	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-2.08	□□□□□ -2.74
YLR053C	Q12026	YPL038W-A	YPL038W-A	192 nt		-2.12	□□□□□ -2.75
YLR053C	Q12026	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-2.14	□□□□□ -2.75
YLR053C	Q12026	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-2.14	□□□□□ -2.75
YLR053C	Q12026	YPR197C	YPR197C	564 nt		-2.14	□□□□□ -2.75
YLR053C	Q12026	tF(GAA)Q	tF(GAA)Q	75 nt		-2.16	□□□□□ -2.76
YLR053C	Q12026	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-2.16	□□□□□ -2.76
YLR053C	Q12026	YBR131C-A	YBR131C-A	90 nt		-2.16	□□□□□ -2.76
YLR053C	Q12026	YBR178W	YBR178W	375 nt		-2.17	□□□□□ -2.76
YLR053C	Q12026	YER181C	YER181C	324 nt		-2.18	□□□□□ -2.76
YLR053C	Q12026	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-2.19	□□□□□ -2.76
YLR053C	Q12026	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-2.22	□□□□□ -2.76
YLR053C	Q12026	RPL39	YJL189W	156 nt		-2.25	□□□□□ -2.77
YLR053C	Q12026	YNL205C	YNL205C	423 nt		-2.25	□□□□□ -2.77
YLR053C	Q12026	YDR413C	YDR413C	576 nt		-2.26	□□□□□ -2.77
YLR053C	Q12026	snR77	snR77	88 nt		-2.29	□□□□□ -2.78
YLR053C	Q12026	YDR157W	YDR157W	402 nt		-2.29	□□□□□ -2.78
YLR053C	Q12026	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		-2.34	□□□□□ -2.78
YLR053C	Q12026	snR81	snR81	201 nt		-2.35	□□□□□ -2.79
YLR053C	Q12026	snR55	snR55	98 nt		-2.38	□□□□□ -2.79
YLR053C	Q12026	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		-2.38	□□□□□ -2.79
YLR053C	Q12026	Q0017	Q0017	162 nt		-2.4	□□□□□ -2.79
YLR053C	Q12026	YDL240C-A	YDL240C-A	138 nt		-2.41	□□□□□ -2.8
YLR053C	Q12026	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-2.41	□□□□□ -2.8
YLR053C	Q12026	YLR222C-A	YLR222C-A	231 nt		-2.42	□□□□□ -2.8
YLR053C	Q12026	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-2.45	□□□□□ -2.8
YLR053C	Q12026	snR48	snR48	113 nt		-2.45	□□□□□ -2.8
YLR053C	Q12026	YKL118W	YKL118W	312 nt		-2.46	□□□□□ -2.8
YLR053C	Q12026	YOR102W	YOR102W	351 nt		-2.48	□□□□□ -2.81
YLR053C	Q12026	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-2.53	□□□□□ -2.81
YLR053C	Q12026	YDR118W-A	YDR118W-A	117 nt		-2.54	□□□□□ -2.82
YLR053C	Q12026	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-2.54	□□□□□ -2.82
YLR053C	Q12026	GIM4	YEL003W	336 nt		-2.56	□□□□□ -2.82
YLR053C	Q12026	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-2.56	□□□□□ -2.82
YLR053C	Q12026	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-2.59	□□□□□ -2.82
YLR053C	Q12026	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-2.6	□□□□□ -2.83
YLR053C	Q12026	YOL155W-A	YOL155W-A	135 nt		-2.61	□□□□□ -2.83
YLR053C	Q12026	YOR302W	YOR302W	78 nt		-2.64	□□□□□ -2.83
YLR053C	Q12026	VAR1	Q0140	1197 nt		-2.74	□□□□□ -2.85
YLR053C	Q12026	snR52	snR52	92 nt		-2.74	□□□□□ -2.85
YLR053C	Q12026	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-2.75	□□□□□ -2.85
YLR053C	Q12026	YPR012W	YPR012W	255 nt		-2.75	□□□□□ -2.85
YLR053C	Q12026	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-2.76	□□□□□ -2.85
YLR053C	Q12026	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-2.76	□□□□□ -2.85
YLR053C	Q12026	YOR309C	YOR309C	381 nt		-2.76	□□□□□ -2.85
YLR053C	Q12026	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		-2.81	□□□□□ -2.86
YLR053C	Q12026	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-2.83	□□□□□ -2.86
YLR053C	Q12026	snR65	snR65	100 nt		-2.89	□□□□□ -2.87
YLR053C	Q12026	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-2.9	□□□□□ -2.87
YLR053C	Q12026	YJL150W	YJL150W	303 nt		-2.93	□□□□□ -2.88
YLR053C	Q12026	YNL198C	YNL198C	303 nt		-2.98	□□□□□ -2.89
YLR053C	Q12026	snR56	snR56	88 nt		-3.13	□□□□□ -2.91
YLR053C	Q12026	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		-3.13	□□□□□ -2.91
YLR053C	Q12026	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-3.13	□□□□□ -2.91
YLR053C	Q12026	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-3.14	□□□□□ -2.91
YLR053C	Q12026	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-3.18	□□□□□ -2.92
YLR053C	Q12026	snR80	snR80	171 nt		-3.19	□□□□□ -2.92
YLR053C	Q12026	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-3.19	□□□□□ -2.92
YLR053C	Q12026	RPL41A	YDL184C	78 nt		-3.23	□□□□□ -2.93
YLR053C	Q12026	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-3.3	□□□□□ -2.94
YLR053C	Q12026	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-3.34	□□□□□ -2.94
YLR053C	Q12026	YBL053W	YBL053W	375 nt		-3.34	□□□□□ -2.94
YLR053C	Q12026	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		-3.35	□□□□□ -2.95
YLR053C	Q12026	snR38	snR38	95 nt		-3.38	□□□□□ -2.95
YLR053C	Q12026	snR6	snR6	112 nt		-3.4	□□□□□ -2.95
YLR053C	Q12026	YDR543C	YDR543C	300 nt		-3.4	□□□□□ -2.95
YLR053C	Q12026	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		-3.42	□□□□□ -2.96
YLR053C	Q12026	YGR151C	YGR151C	336 nt		-3.51	□□□□□ -2.97
YLR053C	Q12026	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-3.52	□□□□□ -2.97
YLR053C	Q12026	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-3.57	□□□□□ -2.98
YLR053C	Q12026	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-3.59	□□□□□ -2.98
YLR053C	Q12026	snR73	snR73	106 nt		-3.6	□□□□□ -2.99
YLR053C	Q12026	Q0144	Q0144	330 nt		-3.6	□□□□□ -2.99
YLR053C	Q12026	tR(ACG)Q2	tR(ACG)Q2	74 nt		-3.6	□□□□□ -2.99
YLR053C	Q12026	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-3.63	□□□□□ -2.99
YLR053C	Q12026	snR47	snR47	99 nt		-3.7	□□□□□ -3
YLR053C	Q12026	YOL166W-A	YOL166W-A	156 nt		-3.75	□□□□□ -3.01
YLR053C	Q12026	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-3.76	□□□□□ -3.01
YLR053C	Q12026	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-3.8	□□□□□ -3.02
YLR053C	Q12026	YDR524C-A	YDR524C-A	120 nt		-3.89	□□□□□ -3.03
YLR053C	Q12026	Q0142	Q0142	177 nt		-3.92	□□□□□ -3.04
YLR053C	Q12026	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-3.95	□□□□□ -3.04
YLR053C	Q12026	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-3.95	□□□□□ -3.04
YLR053C	Q12026	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-3.96	□□□□□ -3.04
YLR053C	Q12026	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-3.97	□□□□□ -3.04
YLR053C	Q12026	YKL225W	YKL225W	348 nt		-4	□□□□□ -3.05
YLR053C	Q12026	snR85	snR85	171 nt		-4.03	□□□□□ -3.05
YLR053C	Q12026	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-4.09	□□□□□ -3.06
YLR053C	Q12026	SPG3	YDR504C	384 nt		-4.15	□□□□□ -3.07
YLR053C	Q12026	YNL337W	YNL337W	255 nt		-4.24	□□□□□ -3.09
YLR053C	Q12026	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		-4.38	□□□□□ -3.11
YLR053C	Q12026	snR87	snR87	109 nt		-4.41	□□□□□ -3.12
YLR053C	Q12026	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		-4.43	□□□□□ -3.12
YLR053C	Q12026	YGR122C-A	YGR122C-A	129 nt		-4.49	□□□□□ -3.13
YLR053C	Q12026	YNL338W	YNL338W	159 nt		-4.5	□□□□□ -3.13

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