Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC15Q0P6D6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC15Q0P6D6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms