Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNA1Q09470 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms