Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms