Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms