Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms