Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAX8Q06710 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAX8Q06710 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms