Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms