Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms