Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMF1P82094 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMF1P82094 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMF1P82094 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMF1P82094 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMF1P82094 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMF1P82094 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMF1P82094 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TMF1P82094 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMF1P82094 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMF1P82094 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMF1P82094 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMF1P82094 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMF1P82094 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMF1P82094 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMF1P82094 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMF1P82094 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMF1P82094 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMF1P82094 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TMF1P82094 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMF1P82094 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TMF1P82094 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMF1P82094 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMF1P82094 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMF1P82094 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMF1P82094 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMF1P82094 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMF1P82094 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMF1P82094 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMF1P82094 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMF1P82094 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMF1P82094 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMF1P82094 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMF1P82094 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMF1P82094 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMF1P82094 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMF1P82094 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMF1P82094 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMF1P82094 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMF1P82094 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMF1P82094 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMF1P82094 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMF1P82094 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMF1P82094 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMF1P82094 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMF1P82094 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMF1P82094 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMF1P82094 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMF1P82094 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMF1P82094 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMF1P82094 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMF1P82094 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMF1P82094 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMF1P82094 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMF1P82094 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMF1P82094 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMF1P82094 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMF1P82094 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms