Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms