Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP4P57796 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CABP4P57796 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CABP4P57796 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP4P57796 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP4P57796 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP4P57796 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP4P57796 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP4P57796 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP4P57796 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP4P57796 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP4P57796 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP4P57796 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP4P57796 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP4P57796 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP4P57796 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP4P57796 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP4P57796 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP4P57796 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP4P57796 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP4P57796 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP4P57796 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP4P57796 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP4P57796 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP4P57796 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP4P57796 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP4P57796 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP4P57796 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP4P57796 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP4P57796 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP4P57796 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP4P57796 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP4P57796 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP4P57796 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP4P57796 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CABP4P57796 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CABP4P57796 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CABP4P57796 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CABP4P57796 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CABP4P57796 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CABP4P57796 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CABP4P57796 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CABP4P57796 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CABP4P57796 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CABP4P57796 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CABP4P57796 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CABP4P57796 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CABP4P57796 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CABP4P57796 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP4P57796 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP4P57796 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP4P57796 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP4P57796 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP4P57796 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP4P57796 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP4P57796 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP4P57796 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms