Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BACE1P56817 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BACE1P56817 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BACE1P56817 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BACE1P56817 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BACE1P56817 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BACE1P56817 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BACE1P56817 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BACE1P56817 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BACE1P56817 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BACE1P56817 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BACE1P56817 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BACE1P56817 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BACE1P56817 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BACE1P56817 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BACE1P56817 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BACE1P56817 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BACE1P56817 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BACE1P56817 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BACE1P56817 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BACE1P56817 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BACE1P56817 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BACE1P56817 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BACE1P56817 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BACE1P56817 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BACE1P56817 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BACE1P56817 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BACE1P56817 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BACE1P56817 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BACE1P56817 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BACE1P56817 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BACE1P56817 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BACE1P56817 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BACE1P56817 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BACE1P56817 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BACE1P56817 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BACE1P56817 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BACE1P56817 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BACE1P56817 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BACE1P56817 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BACE1P56817 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BACE1P56817 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BACE1P56817 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BACE1P56817 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BACE1P56817 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BACE1P56817 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BACE1P56817 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BACE1P56817 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BACE1P56817 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BACE1P56817 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BACE1P56817 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BACE1P56817 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BACE1P56817 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BACE1P56817 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BACE1P56817 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BACE1P56817 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BACE1P56817 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BACE1P56817 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BACE1P56817 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BACE1P56817 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BACE1P56817 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms