Protein–RNA interactions for Protein: P56470

LGALS4, Galectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS4P56470 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LGALS4P56470 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LGALS4P56470 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LGALS4P56470 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LGALS4P56470 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGALS4P56470 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms