Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms