Protein–RNA interactions for Protein: P53730

ALG12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ALG12P53730 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
ALG12P53730 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
ALG12P53730 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.63□□□□□ -2.31
ALG12P53730 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
ALG12P53730 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
ALG12P53730 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
ALG12P53730 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
ALG12P53730 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.63□□□□□ -2.31
ALG12P53730 RCO1YMR075W 2055 nt0.63□□□□□ -2.31
ALG12P53730 ORC3YLL004W 1851 nt0.6□□□□□ -2.31
ALG12P53730 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.59□□□□□ -2.31
ALG12P53730 YLR294CYLR294C 330 nt0.58□□□□□ -2.32
ALG12P53730 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.57□□□□□ -2.32
ALG12P53730 AI1Q0050 2505 nt0.54□□□□□ -2.32
ALG12P53730 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.52□□□□□ -2.33
ALG12P53730 YBL053WYBL053W 375 nt0.52□□□□□ -2.33
ALG12P53730 FMP27YLR454W 7887 nt0.5□□□□□ -2.33
ALG12P53730 YBR099CYBR099C 384 nt0.49□□□□□ -2.33
ALG12P53730 THO2YNL139C 4794 nt0.49□□□□□ -2.33
ALG12P53730 YNL205CYNL205C 423 nt0.47□□□□□ -2.33
ALG12P53730 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.46□□□□□ -2.34
ALG12P53730 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.44□□□□□ -2.34
ALG12P53730 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.43□□□□□ -2.34
ALG12P53730 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.41□□□□□ -2.34
ALG12P53730 YGR164WYGR164W 336 nt0.38□□□□□ -2.35
ALG12P53730 PMP2YEL017C-A 132 nt0.36□□□□□ -2.35
ALG12P53730 SOM1YEL059C-A 225 nt0.36□□□□□ -2.35
ALG12P53730 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.36□□□□□ -2.35
ALG12P53730 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.34□□□□□ -2.36
ALG12P53730 EST1YLR233C 2100 nt0.33□□□□□ -2.36
ALG12P53730 snR69snR69 101 nt0.31□□□□□ -2.36
ALG12P53730 ESP1YGR098C 4893 nt0.27□□□□□ -2.37
ALG12P53730 SEC10YLR166C 2616 nt0.26□□□□□ -2.37
ALG12P53730 RDS3YPR094W 324 nt0.25□□□□□ -2.37
ALG12P53730 YNL266WYNL266W 420 nt0.23□□□□□ -2.37
ALG12P53730 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.22□□□□□ -2.37
ALG12P53730 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.22□□□□□ -2.37
ALG12P53730 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.2□□□□□ -2.38
ALG12P53730 SOV1YMR066W 2697 nt0.2□□□□□ -2.38
ALG12P53730 YNL170WYNL170W 396 nt0.15□□□□□ -2.39
ALG12P53730 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.13□□□□□ -2.39
ALG12P53730 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.12□□□□□ -2.39
ALG12P53730 ATP8Q0080 147 nt0.11□□□□□ -2.39
ALG12P53730 snR128snR128 126 nt0.11□□□□□ -2.39
ALG12P53730 YBR178WYBR178W 375 nt0.1□□□□□ -2.39
ALG12P53730 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.06□□□□□ -2.4
ALG12P53730 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.06□□□□□ -2.4
ALG12P53730 snR45snR45 172 nt0.06□□□□□ -2.4
ALG12P53730 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.04□□□□□ -2.4
ALG12P53730 Q0092Q0092 141 nt-0.01□□□□□ -2.41
ALG12P53730 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.05□□□□□ -2.42
ALG12P53730 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.09□□□□□ -2.42
ALG12P53730 snR50snR50 90 nt-0.09□□□□□ -2.42
ALG12P53730 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.13□□□□□ -2.43
ALG12P53730 SBH2YER019C-A 267 nt-0.16□□□□□ -2.44
ALG12P53730 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.17□□□□□ -2.44
ALG12P53730 snR67snR67 82 nt-0.2□□□□□ -2.44
ALG12P53730 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.26□□□□□ -2.45
ALG12P53730 snR61snR61 90 nt-0.32□□□□□ -2.46
ALG12P53730 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.32□□□□□ -2.46
ALG12P53730 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.32□□□□□ -2.46
ALG12P53730 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.34□□□□□ -2.46
ALG12P53730 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.34□□□□□ -2.46
ALG12P53730 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.37□□□□□ -2.47
ALG12P53730 SKI7YOR076C 2244 nt-0.38□□□□□ -2.47
ALG12P53730 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.4□□□□□ -2.47
ALG12P53730 snR81snR81 201 nt-0.41□□□□□ -2.48
ALG12P53730 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.41□□□□□ -2.48
ALG12P53730 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.44□□□□□ -2.48
ALG12P53730 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.45□□□□□ -2.48
ALG12P53730 Q0143Q0143 153 nt-0.46□□□□□ -2.48
ALG12P53730 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.46□□□□□ -2.48
ALG12P53730 snR161snR161 161 nt-0.5□□□□□ -2.49
ALG12P53730 snR47snR47 99 nt-0.53□□□□□ -2.49
ALG12P53730 RPL41AYDL184C 78 nt-0.54□□□□□ -2.5
ALG12P53730 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.55□□□□□ -2.5
ALG12P53730 URB1YKL014C 5295 nt-0.55□□□□□ -2.5
ALG12P53730 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.58□□□□□ -2.5
ALG12P53730 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.6□□□□□ -2.51
ALG12P53730 snR33snR33 183 nt-0.6□□□□□ -2.51
ALG12P53730 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.61□□□□□ -2.51
ALG12P53730 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.63□□□□□ -2.51
ALG12P53730 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.64□□□□□ -2.51
ALG12P53730 snR38snR38 95 nt-0.64□□□□□ -2.51
ALG12P53730 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.66□□□□□ -2.52
ALG12P53730 snR85snR85 171 nt-0.69□□□□□ -2.52
ALG12P53730 YMR326CYMR326C 309 nt-0.71□□□□□ -2.52
ALG12P53730 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.74□□□□□ -2.53
ALG12P53730 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.76□□□□□ -2.53
ALG12P53730 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.76□□□□□ -2.53
ALG12P53730 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.76□□□□□ -2.53
ALG12P53730 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.76□□□□□ -2.53
ALG12P53730 YKL225WYKL225W 348 nt-0.76□□□□□ -2.53
ALG12P53730 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.79□□□□□ -2.54
ALG12P53730 snR62snR62 100 nt-0.81□□□□□ -2.54
ALG12P53730 snR77snR77 88 nt-0.81□□□□□ -2.54
ALG12P53730 YNR077CYNR077C 255 nt-0.82□□□□□ -2.54
ALG12P53730 YHR217CYHR217C 462 nt-0.84□□□□□ -2.54
ALG12P53730 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.87□□□□□ -2.55
ALG12P53730 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.92□□□□□ -2.56
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