Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeast

Predictions only

Length 365 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN9	P53437	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
RRN9	P53437	SOV1	YMR066W	2697 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
RRN9	P53437	SPG3	YDR504C	384 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
RRN9	P53437	YER078W-A	YER078W-A	165 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
RRN9	P53437	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
RRN9	P53437	RPM2	YML091C	3609 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
RRN9	P53437	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
RRN9	P53437	YJL077W-A	YJL077W-A	87 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
RRN9	P53437	JLP2	YMR132C	627 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
RRN9	P53437	snR48	snR48	113 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
RRN9	P53437	THO2	YNL139C	4794 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
RRN9	P53437	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
RRN9	P53437	YOR102W	YOR102W	351 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
RRN9	P53437	tQ(UUG)Q	tQ(UUG)Q	76 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
RRN9	P53437	snR45	snR45	172 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
RRN9	P53437	YJL150W	YJL150W	303 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
RRN9	P53437	YGR164W	YGR164W	336 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
RRN9	P53437	snR69	snR69	101 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
RRN9	P53437	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
RRN9	P53437	YNL067W-B	YNL067W-B	141 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
RRN9	P53437	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
RRN9	P53437	PMP2	YEL017C-A	132 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
RRN9	P53437	SBH2	YER019C-A	267 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
RRN9	P53437	YNL205C	YNL205C	423 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
RRN9	P53437	RDS3	YPR094W	324 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
RRN9	P53437	YNL198C	YNL198C	303 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
RRN9	P53437	SEC10	YLR166C	2616 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
RRN9	P53437	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-0.31	□□□□□ -2.46
RRN9	P53437	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		-0.33	□□□□□ -2.46
RRN9	P53437	YIL071W-A	YIL071W-A	477 nt		-0.33	□□□□□ -2.46
RRN9	P53437	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
RRN9	P53437	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
RRN9	P53437	YBL053W	YBL053W	375 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
RRN9	P53437	YBR178W	YBR178W	375 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
RRN9	P53437	YGR151C	YGR151C	336 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
RRN9	P53437	snR50	snR50	90 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
RRN9	P53437	YPL060C-A	YPL060C-A	3315 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
RRN9	P53437	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-0.37	□□□□□ -2.47
RRN9	P53437	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-0.39	□□□□□ -2.47
RRN9	P53437	YNL266W	YNL266W	420 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
RRN9	P53437	TFB5	YDR079C-A	219 nt		-0.41	□□□□□ -2.48
RRN9	P53437	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
RRN9	P53437	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
RRN9	P53437	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
RRN9	P53437	YNL337W	YNL337W	255 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
RRN9	P53437	YNL338W	YNL338W	159 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
RRN9	P53437	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-0.49	□□□□□ -2.49
RRN9	P53437	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-0.49	□□□□□ -2.49
RRN9	P53437	snR67	snR67	82 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
RRN9	P53437	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
RRN9	P53437	URB1	YKL014C	5295 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
RRN9	P53437	Q0032	Q0032	291 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
RRN9	P53437	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
RRN9	P53437	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
RRN9	P53437	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
RRN9	P53437	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
RRN9	P53437	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
RRN9	P53437	YGL007C-A	YGL007C-A	87 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
RRN9	P53437	snR33	snR33	183 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
RRN9	P53437	SKI7	YOR076C	2244 nt		-0.72	□□□□□ -2.53
RRN9	P53437	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
RRN9	P53437	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
RRN9	P53437	snR161	snR161	161 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
RRN9	P53437	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
RRN9	P53437	YLR294C	YLR294C	330 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
RRN9	P53437	YOR225W	YOR225W	330 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
RRN9	P53437	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
RRN9	P53437	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
RRN9	P53437	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
RRN9	P53437	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
RRN9	P53437	RPL41A	YDL184C	78 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
RRN9	P53437	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-1	□□□□□ -2.57
RRN9	P53437	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-1	□□□□□ -2.57
RRN9	P53437	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
RRN9	P53437	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
RRN9	P53437	snR81	snR81	201 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
RRN9	P53437	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
RRN9	P53437	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
RRN9	P53437	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
RRN9	P53437	snR47	snR47	99 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
RRN9	P53437	YNL170W	YNL170W	396 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
RRN9	P53437	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
RRN9	P53437	YGL041C-B	YGL041C-B	183 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
RRN9	P53437	YNL103W-A	YNL103W-A	90 nt		-1.18	□□□□□ -2.6
RRN9	P53437	snR61	snR61	90 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
RRN9	P53437	snR38	snR38	95 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
RRN9	P53437	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-1.22	□□□□□ -2.6
RRN9	P53437	ATP8	Q0080	147 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
RRN9	P53437	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
RRN9	P53437	snR77	snR77	88 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
RRN9	P53437	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
RRN9	P53437	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-1.32	□□□□□ -2.62
RRN9	P53437	YKL225W	YKL225W	348 nt		-1.38	□□□□□ -2.63
RRN9	P53437	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-1.42	□□□□□ -2.64
RRN9	P53437	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-1.42	□□□□□ -2.64
RRN9	P53437	snR62	snR62	100 nt		-1.46	□□□□□ -2.64
RRN9	P53437	Q0092	Q0092	141 nt		-1.5	□□□□□ -2.65
RRN9	P53437	YNR077C	YNR077C	255 nt		-1.52	□□□□□ -2.65
RRN9	P53437	Q0143	Q0143	153 nt		-1.6	□□□□□ -2.67
RRN9	P53437	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-1.66	□□□□□ -2.68

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