Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP1P53367 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms