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Protein–RNA interactions for Protein: P53238
PEF1, Peflin, yeast
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335 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
PEF1
P53238
tF(GAA)H1
tF(GAA)H1
73 nt
0.62
□□□□□ -2.31
PEF1
P53238
tF(GAA)H2
tF(GAA)H2
73 nt
0.62
□□□□□ -2.31
PEF1
P53238
tF(GAA)M
tF(GAA)M
73 nt
0.62
□□□□□ -2.31
PEF1
P53238
tF(GAA)P1
tF(GAA)P1
73 nt
0.62
□□□□□ -2.31
PEF1
P53238
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tF(GAA)P2
73 nt
0.62
□□□□□ -2.31
PEF1
P53238
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tT(AGU)B
73 nt
0.62
□□□□□ -2.31
PEF1
P53238
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tT(AGU)C
73 nt
0.62
□□□□□ -2.31
PEF1
P53238
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tT(AGU)D
73 nt
0.62
□□□□□ -2.31
PEF1
P53238
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tT(AGU)H
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□□□□□ -2.31
PEF1
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tT(AGU)I1
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0.62
□□□□□ -2.31
PEF1
P53238
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tT(AGU)I2
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□□□□□ -2.31
PEF1
P53238
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tT(AGU)J
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□□□□□ -2.31
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P53238
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tT(AGU)N1
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□□□□□ -2.31
PEF1
P53238
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tT(AGU)N2
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□□□□□ -2.31
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P53238
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tT(AGU)O1
73 nt
0.62
□□□□□ -2.31
PEF1
P53238
tT(AGU)O2
tT(AGU)O2
73 nt
0.62
□□□□□ -2.31
PEF1
P53238
YMR160W
YMR160W
2451 nt
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□□□□□ -2.31
PEF1
P53238
MLP1
YKR095W
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□□□□□ -2.32
PEF1
P53238
PMP2
YEL017C-A
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0.58
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PEF1
P53238
YNL266W
YNL266W
420 nt
0.58
□□□□□ -2.32
PEF1
P53238
RCO1
YMR075W
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0.58
□□□□□ -2.32
PEF1
P53238
SEC10
YLR166C
2616 nt
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□□□□□ -2.32
PEF1
P53238
EST1
YLR233C
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□□□□□ -2.32
PEF1
P53238
snR69
snR69
101 nt
0.53
□□□□□ -2.32
PEF1
P53238
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YBR178W
375 nt
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□□□□□ -2.32
PEF1
P53238
Q0143
Q0143
153 nt
0.5
□□□□□ -2.33
PEF1
P53238
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YJL077W-A
87 nt
0.5
□□□□□ -2.33
PEF1
P53238
FMP27
YLR454W
7887 nt
0.49
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PEF1
P53238
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YKL145W-A
93 nt
0.48
□□□□□ -2.33
PEF1
P53238
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YOL014W
375 nt
0.48
□□□□□ -2.33
PEF1
P53238
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YBR196C-A
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PEF1
P53238
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YBL100W-B
5313 nt
0.48
□□□□□ -2.33
PEF1
P53238
tD(GUC)Q
tD(GUC)Q
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0.47
□□□□□ -2.33
PEF1
P53238
YOR186C-A
YOR186C-A
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0.45
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PEF1
P53238
RDS3
YPR094W
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0.45
□□□□□ -2.34
PEF1
P53238
tQ(UUG)Q
tQ(UUG)Q
76 nt
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□□□□□ -2.34
PEF1
P53238
snR85
snR85
171 nt
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□□□□□ -2.34
PEF1
P53238
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YNL103W-A
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□□□□□ -2.34
PEF1
P53238
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YPL060C-A
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PEF1
P53238
IQG1
YPL242C
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PEF1
P53238
MLP2
YIL149C
5040 nt
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PEF1
P53238
AI1
Q0050
2505 nt
0.37
□□□□□ -2.35
PEF1
P53238
snR61
snR61
90 nt
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PEF1
P53238
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YLR286W-A
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PEF1
P53238
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YDL159C-B
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PEF1
P53238
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YLR299C-A
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PEF1
P53238
TFB5
YDR079C-A
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PEF1
P53238
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YGL041C-B
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PEF1
P53238
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YOL013W-A
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PEF1
P53238
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YNL054W-B
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PEF1
P53238
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PEF1
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PEF1
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YAL037C-A
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snR81
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PEF1
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PEF1
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YER078W-A
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P53238
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YMR326C
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P53238
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snR128
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P53238
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YNL139C
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YBL109W
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PEF1
P53238
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YOL164W-A
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PEF1
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YML054C-A
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PEF1
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snR67
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P53238
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YHR180C-B
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YBL100W-C
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PEF1
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YHR217C
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YML100W-A
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snR45
snR45
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YGR240C-A
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snR47
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tS(GCU)Q1
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PEF1
P53238
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YJL113W
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PEF1
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snR62
snR62
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PEF1
P53238
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PAU9
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PEF1
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YBR109W-A
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P53238
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YDR034C-A
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P53238
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PEF1
P53238
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YDL247W-A
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PEF1
P53238
snR38
snR38
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PEF1
P53238
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PEF1
P53238
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YLL066W-B
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PEF1
P53238
YKL225W
YKL225W
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PEF1
P53238
URB1
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PEF1
P53238
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YKL106C-A
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PEF1
P53238
snR64
snR64
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P53238
YOR376W-A
YOR376W-A
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□□□□□ -2.49
PEF1
P53238
snR161
snR161
161 nt
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PEF1
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tT(UGU)G1
tT(UGU)G1
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□□□□□ -2.49
PEF1
P53238
tT(UGU)G2
tT(UGU)G2
72 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
PEF1
P53238
tT(UGU)P
tT(UGU)P
72 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
PEF1
P53238
snR33
snR33
183 nt
-0.59
□□□□□ -2.5
PEF1
P53238
YOR316C-A
YOR316C-A
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-0.61
□□□□□ -2.51
PEF1
P53238
YDL159W-A
YDL159W-A
132 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
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