Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC3P51654 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC3P51654 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC3P51654 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC3P51654 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC3P51654 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC3P51654 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC3P51654 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC3P51654 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC3P51654 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC3P51654 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC3P51654 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC3P51654 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC3P51654 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC3P51654 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC3P51654 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC3P51654 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC3P51654 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC3P51654 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC3P51654 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC3P51654 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC3P51654 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC3P51654 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC3P51654 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC3P51654 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC3P51654 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC3P51654 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC3P51654 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC3P51654 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC3P51654 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC3P51654 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPC3P51654 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
GPC3P51654 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPC3P51654 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC3P51654 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms