Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA8P48165 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA8P48165 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA8P48165 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA8P48165 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA8P48165 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA8P48165 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA8P48165 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA8P48165 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA8P48165 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA8P48165 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA8P48165 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA8P48165 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA8P48165 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA8P48165 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA8P48165 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA8P48165 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA8P48165 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA8P48165 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA8P48165 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA8P48165 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA8P48165 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA8P48165 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA8P48165 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA8P48165 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA8P48165 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA8P48165 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms