Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms