Protein–RNA interactions for Protein: P36075

CUE2, Ubiquitin-binding protein CUE2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE2P36075 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.21□□□□□ -2.22
CUE2P36075 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.21□□□□□ -2.22
CUE2P36075 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.21□□□□□ -2.22
CUE2P36075 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.21□□□□□ -2.22
CUE2P36075 YML054C-AYML054C-A 159 nt1.21□□□□□ -2.22
CUE2P36075 CSE1YGL238W 2883 nt1.2□□□□□ -2.22
CUE2P36075 YCS4YLR272C 3531 nt1.2□□□□□ -2.22
CUE2P36075 YER078W-AYER078W-A 165 nt1.19□□□□□ -2.22
CUE2P36075 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.18□□□□□ -2.22
CUE2P36075 AI1Q0050 2505 nt1.17□□□□□ -2.22
CUE2P36075 ULP2YIL031W 3105 nt1.17□□□□□ -2.22
CUE2P36075 YSP1YHR155W 3687 nt1.17□□□□□ -2.22
CUE2P36075 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.17□□□□□ -2.22
CUE2P36075 YGR130CYGR130C 2451 nt1.16□□□□□ -2.22
CUE2P36075 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.16□□□□□ -2.22
CUE2P36075 RPL41AYDL184C 78 nt1.15□□□□□ -2.23
CUE2P36075 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt1.15□□□□□ -2.23
CUE2P36075 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt1.15□□□□□ -2.23
CUE2P36075 RDS3YPR094W 324 nt1.15□□□□□ -2.23
CUE2P36075 HUG1YML058W-A 207 nt1.12□□□□□ -2.23
CUE2P36075 IML1YJR138W 4755 nt1.12□□□□□ -2.23
CUE2P36075 snR75snR75 89 nt1.11□□□□□ -2.23
CUE2P36075 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt1.11□□□□□ -2.23
CUE2P36075 PAU12YGR294W 363 nt1.1□□□□□ -2.23
CUE2P36075 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.1□□□□□ -2.23
CUE2P36075 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.1□□□□□ -2.23
CUE2P36075 NIP1YMR309C 2439 nt1.1□□□□□ -2.23
CUE2P36075 SKI7YOR076C 2244 nt1.09□□□□□ -2.23
CUE2P36075 VAM6YDL077C 3150 nt1.08□□□□□ -2.24
CUE2P36075 SPT7YBR081C 3999 nt1.08□□□□□ -2.24
CUE2P36075 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt1.07□□□□□ -2.24
CUE2P36075 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.07□□□□□ -2.24
CUE2P36075 BUL2YML111W 2763 nt1.06□□□□□ -2.24
CUE2P36075 BEM2YER155C 6504 nt1.05□□□□□ -2.24
CUE2P36075 SIP4YJL089W 2490 nt1.04□□□□□ -2.24
CUE2P36075 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.03□□□□□ -2.24
CUE2P36075 SCC2YDR180W 4482 nt1.02□□□□□ -2.25
CUE2P36075 RKR1YMR247C 4689 nt1.01□□□□□ -2.25
CUE2P36075 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.01□□□□□ -2.25
CUE2P36075 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.01□□□□□ -2.25
CUE2P36075 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.01□□□□□ -2.25
CUE2P36075 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.01□□□□□ -2.25
CUE2P36075 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.01□□□□□ -2.25
CUE2P36075 DOP1YDR141C 5097 nt1.01□□□□□ -2.25
CUE2P36075 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1□□□□□ -2.25
CUE2P36075 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.98□□□□□ -2.25
CUE2P36075 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.95□□□□□ -2.26
CUE2P36075 YJR029WYJR029W 5268 nt0.95□□□□□ -2.26
CUE2P36075 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.95□□□□□ -2.26
CUE2P36075 PET111YMR257C 2403 nt0.94□□□□□ -2.26
CUE2P36075 UTP20YBL004W 7482 nt0.89□□□□□ -2.27
CUE2P36075 PAU24YBR301W 363 nt0.89□□□□□ -2.27
CUE2P36075 YPR117WYPR117W 7470 nt0.84□□□□□ -2.27
CUE2P36075 snR67snR67 82 nt0.81□□□□□ -2.28
CUE2P36075 MLP2YIL149C 5040 nt0.8□□□□□ -2.28
CUE2P36075 YMR160WYMR160W 2451 nt0.78□□□□□ -2.28
CUE2P36075 LTE1YAL024C 4308 nt0.73□□□□□ -2.29
CUE2P36075 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE2P36075 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE2P36075 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE2P36075 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE2P36075 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE2P36075 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE2P36075 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE2P36075 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE2P36075 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE2P36075 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE2P36075 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE2P36075 THO2YNL139C 4794 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE2P36075 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.71□□□□□ -2.3
CUE2P36075 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.71□□□□□ -2.3
CUE2P36075 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.65□□□□□ -2.31
CUE2P36075 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE2P36075 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE2P36075 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE2P36075 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE2P36075 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE2P36075 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE2P36075 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE2P36075 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE2P36075 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE2P36075 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE2P36075 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE2P36075 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE2P36075 IQG1YPL242C 4488 nt0.59□□□□□ -2.32
CUE2P36075 YOL014WYOL014W 375 nt0.57□□□□□ -2.32
CUE2P36075 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.56□□□□□ -2.32
CUE2P36075 FMP27YLR454W 7887 nt0.56□□□□□ -2.32
CUE2P36075 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.53□□□□□ -2.32
CUE2P36075 UTP10YJL109C 5310 nt0.53□□□□□ -2.32
CUE2P36075 snR40snR40 97 nt0.51□□□□□ -2.33
CUE2P36075 snR77snR77 88 nt0.48□□□□□ -2.33
CUE2P36075 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.47□□□□□ -2.33
CUE2P36075 SOV1YMR066W 2697 nt0.46□□□□□ -2.34
CUE2P36075 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.46□□□□□ -2.34
CUE2P36075 MLP1YKR095W 5628 nt0.45□□□□□ -2.34
CUE2P36075 SBH2YER019C-A 267 nt0.39□□□□□ -2.35
CUE2P36075 ESP1YGR098C 4893 nt0.37□□□□□ -2.35
CUE2P36075 PAU9YBL108C-A 129 nt0.35□□□□□ -2.35
CUE2P36075 snR128snR128 126 nt0.32□□□□□ -2.36
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