Protein–RNA interactions for Protein: P32786

RRN6, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN6, yeastyeast

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN6P32786 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt1.33□□□□□ -2.2
RRN6P32786 RKR1YMR247C 4689 nt1.32□□□□□ -2.2
RRN6P32786 YPR117WYPR117W 7470 nt1.32□□□□□ -2.2
RRN6P32786 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt1.3□□□□□ -2.2
RRN6P32786 BUD3YCL014W 4911 nt1.3□□□□□ -2.2
RRN6P32786 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt1.29□□□□□ -2.2
RRN6P32786 NIP1YMR309C 2439 nt1.28□□□□□ -2.2
RRN6P32786 RDS3YPR094W 324 nt1.25□□□□□ -2.21
RRN6P32786 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.24□□□□□ -2.21
RRN6P32786 YJR029WYJR029W 5268 nt1.23□□□□□ -2.21
RRN6P32786 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.23□□□□□ -2.21
RRN6P32786 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.23□□□□□ -2.21
RRN6P32786 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.22□□□□□ -2.21
RRN6P32786 SIP4YJL089W 2490 nt1.21□□□□□ -2.22
RRN6P32786 ORC3YLL004W 1851 nt1.2□□□□□ -2.22
RRN6P32786 snR47snR47 99 nt1.18□□□□□ -2.22
RRN6P32786 PAU12YGR294W 363 nt1.17□□□□□ -2.22
RRN6P32786 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.17□□□□□ -2.22
RRN6P32786 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.17□□□□□ -2.22
RRN6P32786 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.16□□□□□ -2.22
RRN6P32786 PAU24YBR301W 363 nt1.14□□□□□ -2.23
RRN6P32786 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.12□□□□□ -2.23
RRN6P32786 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.12□□□□□ -2.23
RRN6P32786 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.12□□□□□ -2.23
RRN6P32786 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.12□□□□□ -2.23
RRN6P32786 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.12□□□□□ -2.23
RRN6P32786 IML1YJR138W 4755 nt1.11□□□□□ -2.23
RRN6P32786 BEM2YER155C 6504 nt1.1□□□□□ -2.23
RRN6P32786 IQG1YPL242C 4488 nt1.1□□□□□ -2.23
RRN6P32786 DOP1YDR141C 5097 nt1.09□□□□□ -2.23
RRN6P32786 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.09□□□□□ -2.23
RRN6P32786 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt1.09□□□□□ -2.23
RRN6P32786 VAM6YDL077C 3150 nt1.09□□□□□ -2.24
RRN6P32786 MLP1YKR095W 5628 nt1.09□□□□□ -2.24
RRN6P32786 PET111YMR257C 2403 nt1.06□□□□□ -2.24
RRN6P32786 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.04□□□□□ -2.24
RRN6P32786 YML054C-AYML054C-A 159 nt1.04□□□□□ -2.24
RRN6P32786 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.99□□□□□ -2.25
RRN6P32786 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.99□□□□□ -2.25
RRN6P32786 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.99□□□□□ -2.25
RRN6P32786 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
RRN6P32786 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
RRN6P32786 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.99□□□□□ -2.25
RRN6P32786 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
RRN6P32786 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
RRN6P32786 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.99□□□□□ -2.25
RRN6P32786 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.98□□□□□ -2.25
RRN6P32786 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.97□□□□□ -2.25
RRN6P32786 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.97□□□□□ -2.25
RRN6P32786 snR64snR64 101 nt0.96□□□□□ -2.26
RRN6P32786 snR53snR53 91 nt0.95□□□□□ -2.26
RRN6P32786 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.93□□□□□ -2.26
RRN6P32786 YKL225WYKL225W 348 nt0.92□□□□□ -2.26
RRN6P32786 snR50snR50 90 nt0.92□□□□□ -2.26
RRN6P32786 RPL41AYDL184C 78 nt0.9□□□□□ -2.27
RRN6P32786 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.9□□□□□ -2.27
RRN6P32786 snR38snR38 95 nt0.88□□□□□ -2.27
RRN6P32786 MLP2YIL149C 5040 nt0.87□□□□□ -2.27
RRN6P32786 YOL014WYOL014W 375 nt0.87□□□□□ -2.27
RRN6P32786 AI1Q0050 2505 nt0.8□□□□□ -2.28
RRN6P32786 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.8□□□□□ -2.28
RRN6P32786 YMR160WYMR160W 2451 nt0.79□□□□□ -2.28
RRN6P32786 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt0.76□□□□□ -2.29
RRN6P32786 snR67snR67 82 nt0.75□□□□□ -2.29
RRN6P32786 UTP20YBL004W 7482 nt0.75□□□□□ -2.29
RRN6P32786 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.73□□□□□ -2.29
RRN6P32786 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRN6P32786 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRN6P32786 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRN6P32786 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRN6P32786 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRN6P32786 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRN6P32786 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRN6P32786 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRN6P32786 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRN6P32786 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRN6P32786 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRN6P32786 THO2YNL139C 4794 nt0.68□□□□□ -2.3
RRN6P32786 UTP10YJL109C 5310 nt0.68□□□□□ -2.3
RRN6P32786 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN6P32786 SKI7YOR076C 2244 nt0.64□□□□□ -2.31
RRN6P32786 SOV1YMR066W 2697 nt0.61□□□□□ -2.31
RRN6P32786 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt0.59□□□□□ -2.31
RRN6P32786 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt0.58□□□□□ -2.32
RRN6P32786 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.57□□□□□ -2.32
RRN6P32786 ESP1YGR098C 4893 nt0.56□□□□□ -2.32
RRN6P32786 FMP27YLR454W 7887 nt0.52□□□□□ -2.33
RRN6P32786 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.42□□□□□ -2.34
RRN6P32786 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt0.4□□□□□ -2.35
RRN6P32786 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.39□□□□□ -2.35
RRN6P32786 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.39□□□□□ -2.35
RRN6P32786 snR128snR128 126 nt0.32□□□□□ -2.36
RRN6P32786 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.31□□□□□ -2.36
RRN6P32786 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.28□□□□□ -2.36
RRN6P32786 snR75snR75 89 nt0.25□□□□□ -2.37
RRN6P32786 PAU9YBL108C-A 129 nt0.25□□□□□ -2.37
RRN6P32786 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.24□□□□□ -2.37
RRN6P32786 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.14□□□□□ -2.39
RRN6P32786 snR77snR77 88 nt0.11□□□□□ -2.39
RRN6P32786 SBH2YER019C-A 267 nt0.07□□□□□ -2.4
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