Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC133528.1-201ENST00000608316 805 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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HOXD11P31277 AL445072.1-201ENST00000438994 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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HOXD11P31277 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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HOXD11P31277 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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HOXD11P31277 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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HOXD11P31277 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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HOXD11P31277 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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HOXD11P31277 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC005785.2-201ENST00000624655 631 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
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