Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA1P29973 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms