Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms