Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMLP26374 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMLP26374 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMLP26374 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMLP26374 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMLP26374 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMLP26374 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMLP26374 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMLP26374 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMLP26374 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMLP26374 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMLP26374 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMLP26374 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMLP26374 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMLP26374 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMLP26374 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMLP26374 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMLP26374 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMLP26374 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMLP26374 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMLP26374 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMLP26374 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMLP26374 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMLP26374 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMLP26374 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMLP26374 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMLP26374 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMLP26374 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMLP26374 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMLP26374 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMLP26374 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMLP26374 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMLP26374 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMLP26374 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMLP26374 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMLP26374 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMLP26374 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMLP26374 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMLP26374 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMLP26374 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMLP26374 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMLP26374 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMLP26374 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMLP26374 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMLP26374 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMLP26374 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMLP26374 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMLP26374 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMLP26374 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMLP26374 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMLP26374 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMLP26374 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMLP26374 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMLP26374 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMLP26374 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms