Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms