Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XPAP23025 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XPAP23025 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XPAP23025 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XPAP23025 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XPAP23025 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XPAP23025 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XPAP23025 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XPAP23025 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XPAP23025 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XPAP23025 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XPAP23025 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XPAP23025 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XPAP23025 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XPAP23025 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
XPAP23025 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XPAP23025 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XPAP23025 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XPAP23025 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XPAP23025 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XPAP23025 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XPAP23025 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
XPAP23025 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XPAP23025 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XPAP23025 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XPAP23025 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XPAP23025 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XPAP23025 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XPAP23025 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XPAP23025 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XPAP23025 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XPAP23025 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XPAP23025 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XPAP23025 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XPAP23025 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XPAP23025 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XPAP23025 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XPAP23025 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XPAP23025 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms