Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCP20941 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCP20941 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCP20941 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCP20941 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCP20941 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCP20941 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCP20941 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCP20941 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCP20941 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCP20941 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCP20941 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCP20941 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCP20941 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCP20941 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCP20941 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCP20941 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCP20941 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCP20941 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCP20941 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCP20941 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCP20941 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCP20941 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCP20941 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCP20941 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCP20941 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms