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Protein–RNA interactions for Protein: P20051
URA4, Dihydroorotase, yeast
Predictions only
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364 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
URA4
P20051
EST1
YLR233C
2100 nt
0.04
□□□□□ -2.4
URA4
P20051
YDR406W-A
YDR406W-A
246 nt
0.03
□□□□□ -2.4
URA4
P20051
SPG3
YDR504C
384 nt
0.02
□□□□□ -2.41
URA4
P20051
YMR046W-A
YMR046W-A
129 nt
0.02
□□□□□ -2.41
URA4
P20051
JLP2
YMR132C
627 nt
0.02
□□□□□ -2.41
URA4
P20051
YOR329W-A
YOR329W-A
210 nt
0.02
□□□□□ -2.41
URA4
P20051
snR39B
snR39B
96 nt
0.02
□□□□□ -2.41
URA4
P20051
snR48
snR48
113 nt
0.01
□□□□□ -2.41
URA4
P20051
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tM(CAU)Q2
78 nt
0
□□□□□ -2.41
URA4
P20051
YJL150W
YJL150W
303 nt
0
□□□□□ -2.41
URA4
P20051
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tL(UAA)Q
85 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
URA4
P20051
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YGR146C-A
162 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
URA4
P20051
snR128
snR128
126 nt
-0.06
□□□□□ -2.42
URA4
P20051
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YDL007C-A
258 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
URA4
P20051
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YGR164W
336 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
URA4
P20051
tM(CAU)Q1
tM(CAU)Q1
76 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
URA4
P20051
YOR102W
YOR102W
351 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
URA4
P20051
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YJL077W-A
87 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
URA4
P20051
snR69
snR69
101 nt
-0.13
□□□□□ -2.43
URA4
P20051
YHL015W-A
YHL015W-A
84 nt
-0.13
□□□□□ -2.43
URA4
P20051
YNL198C
YNL198C
303 nt
-0.13
□□□□□ -2.43
URA4
P20051
TFB5
YDR079C-A
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-0.15
□□□□□ -2.43
URA4
P20051
PMP2
YEL017C-A
132 nt
-0.15
□□□□□ -2.43
URA4
P20051
YNL067W-B
YNL067W-B
141 nt
-0.15
□□□□□ -2.43
URA4
P20051
YBL053W
YBL053W
375 nt
-0.16
□□□□□ -2.44
URA4
P20051
tQ(UUG)Q
tQ(UUG)Q
76 nt
-0.19
□□□□□ -2.44
URA4
P20051
YNL205C
YNL205C
423 nt
-0.22
□□□□□ -2.44
URA4
P20051
RDS3
YPR094W
324 nt
-0.23
□□□□□ -2.45
URA4
P20051
YML100W-A
YML100W-A
174 nt
-0.24
□□□□□ -2.45
URA4
P20051
YLR466C-B
YLR466C-B
117 nt
-0.25
□□□□□ -2.45
URA4
P20051
SEC10
YLR166C
2616 nt
-0.26
□□□□□ -2.45
URA4
P20051
YER090C-A
YER090C-A
90 nt
-0.27
□□□□□ -2.45
URA4
P20051
tD(GUC)Q
tD(GUC)Q
75 nt
-0.28
□□□□□ -2.45
URA4
P20051
SBH2
YER019C-A
267 nt
-0.29
□□□□□ -2.46
URA4
P20051
snR50
snR50
90 nt
-0.31
□□□□□ -2.46
URA4
P20051
YNL266W
YNL266W
420 nt
-0.32
□□□□□ -2.46
URA4
P20051
YBR178W
YBR178W
375 nt
-0.32
□□□□□ -2.46
URA4
P20051
YGR151C
YGR151C
336 nt
-0.33
□□□□□ -2.46
URA4
P20051
YLR286W-A
YLR286W-A
135 nt
-0.35
□□□□□ -2.47
URA4
P20051
YJL113W
YJL113W
4647 nt
-0.37
□□□□□ -2.47
URA4
P20051
YNL338W
YNL338W
159 nt
-0.38
□□□□□ -2.47
URA4
P20051
YDL159C-B
YDL159C-B
177 nt
-0.39
□□□□□ -2.47
URA4
P20051
YIL071W-A
YIL071W-A
477 nt
-0.4
□□□□□ -2.47
URA4
P20051
YNL337W
YNL337W
255 nt
-0.4
□□□□□ -2.47
URA4
P20051
SOM1
YEL059C-A
225 nt
-0.42
□□□□□ -2.48
URA4
P20051
tA(UGC)Q
tA(UGC)Q
76 nt
-0.43
□□□□□ -2.48
URA4
P20051
YCR095W-A
YCR095W-A
159 nt
-0.45
□□□□□ -2.48
URA4
P20051
PAU9
YBL108C-A
129 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
URA4
P20051
YBR196C-A
YBR196C-A
150 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
URA4
P20051
YGL007C-A
YGL007C-A
87 nt
-0.49
□□□□□ -2.49
URA4
P20051
URB1
YKL014C
5295 nt
-0.49
□□□□□ -2.49
URA4
P20051
Q0032
Q0032
291 nt
-0.5
□□□□□ -2.49
URA4
P20051
snR67
snR67
82 nt
-0.51
□□□□□ -2.49
URA4
P20051
YLR299C-A
YLR299C-A
93 nt
-0.51
□□□□□ -2.49
URA4
P20051
YCL001W-B
YCL001W-B
255 nt
-0.57
□□□□□ -2.5
URA4
P20051
SKI7
YOR076C
2244 nt
-0.58
□□□□□ -2.5
URA4
P20051
YHL009W-B
YHL009W-B
5409 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
URA4
P20051
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YML054C-A
159 nt
-0.67
□□□□□ -2.52
URA4
P20051
YOR225W
YOR225W
330 nt
-0.67
□□□□□ -2.52
URA4
P20051
snR33
snR33
183 nt
-0.71
□□□□□ -2.52
URA4
P20051
YHR180C-B
YHR180C-B
105 nt
-0.74
□□□□□ -2.53
URA4
P20051
YLR294C
YLR294C
330 nt
-0.75
□□□□□ -2.53
URA4
P20051
tT(UGU)G1
tT(UGU)G1
72 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
URA4
P20051
tT(UGU)G2
tT(UGU)G2
72 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
URA4
P20051
tT(UGU)P
tT(UGU)P
72 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
URA4
P20051
YBL071C-B
YBL071C-B
99 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
URA4
P20051
YOL083C-A
YOL083C-A
141 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
URA4
P20051
snR161
snR161
161 nt
-0.81
□□□□□ -2.54
URA4
P20051
YAL037C-A
YAL037C-A
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-0.86
□□□□□ -2.55
URA4
P20051
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YOL164W-A
183 nt
-0.88
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URA4
P20051
snR81
snR81
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-0.89
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URA4
P20051
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YBR109W-A
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-0.9
□□□□□ -2.55
URA4
P20051
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YNR077C
255 nt
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URA4
P20051
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YOR376W-A
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URA4
P20051
RPL41A
YDL184C
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URA4
P20051
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YNL170W
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URA4
P20051
YBR296C-A
YBR296C-A
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-0.96
□□□□□ -2.56
URA4
P20051
snR38
snR38
95 nt
-0.98
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URA4
P20051
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YNL103W-A
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-1.01
□□□□□ -2.57
URA4
P20051
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YBR223W-A
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-1.01
□□□□□ -2.57
URA4
P20051
snR47
snR47
99 nt
-1.01
□□□□□ -2.57
URA4
P20051
tP(UGG)Q
tP(UGG)Q
72 nt
-1.02
□□□□□ -2.57
URA4
P20051
YGR240C-A
YGR240C-A
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□□□□□ -2.58
URA4
P20051
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YKL106C-A
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-1.06
□□□□□ -2.58
URA4
P20051
ATP8
Q0080
147 nt
-1.07
□□□□□ -2.58
URA4
P20051
snR61
snR61
90 nt
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□□□□□ -2.58
URA4
P20051
YBL100W-C
YBL100W-C
120 nt
-1.08
□□□□□ -2.58
URA4
P20051
YGL041C-B
YGL041C-B
183 nt
-1.09
□□□□□ -2.58
URA4
P20051
snR77
snR77
88 nt
-1.11
□□□□□ -2.59
URA4
P20051
YOR316C-A
YOR316C-A
210 nt
-1.12
□□□□□ -2.59
URA4
P20051
tS(GCU)Q1
tS(GCU)Q1
86 nt
-1.16
□□□□□ -2.6
URA4
P20051
CDC65
tQ(CUG)M
72 nt
-1.17
□□□□□ -2.6
URA4
P20051
YKL225W
YKL225W
348 nt
-1.25
□□□□□ -2.61
URA4
P20051
YDR034C-A
YDR034C-A
177 nt
-1.31
□□□□□ -2.62
URA4
P20051
snR62
snR62
100 nt
-1.32
□□□□□ -2.62
URA4
P20051
Q0092
Q0092
141 nt
-1.32
□□□□□ -2.62
URA4
P20051
tY(GUA)Q
tY(GUA)Q
84 nt
-1.37
□□□□□ -2.63
URA4
P20051
YMR315W-A
YMR315W-A
108 nt
-1.37
□□□□□ -2.63
URA4
P20051
Q0143
Q0143
153 nt
-1.38
□□□□□ -2.63
URA4
P20051
tV(UAC)Q
tV(UAC)Q
76 nt
-1.54
□□□□□ -2.66
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