Protein–RNA interactions for Protein: P18900

COQ1, Hexaprenyl pyrophosphate synthase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
COQ1P18900 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-1.37□□□□□ -2.63
COQ1P18900 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-1.38□□□□□ -2.63
COQ1P18900 RPL39YJL189W 156 nt-1.39□□□□□ -2.63
COQ1P18900 PMP2YEL017C-A 132 nt-1.4□□□□□ -2.63
COQ1P18900 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-1.4□□□□□ -2.63
COQ1P18900 YEL014CYEL014C 306 nt-1.43□□□□□ -2.64
COQ1P18900 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-1.45□□□□□ -2.64
COQ1P18900 YFL019CYFL019C 354 nt-1.45□□□□□ -2.64
COQ1P18900 snR67snR67 82 nt-1.46□□□□□ -2.64
COQ1P18900 snR39BsnR39B 96 nt-1.46□□□□□ -2.64
COQ1P18900 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.47□□□□□ -2.64
COQ1P18900 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-1.48□□□□□ -2.65
COQ1P18900 YER181CYER181C 324 nt-1.48□□□□□ -2.65
COQ1P18900 YDR413CYDR413C 576 nt-1.49□□□□□ -2.65
COQ1P18900 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-1.5□□□□□ -2.65
COQ1P18900 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.5□□□□□ -2.65
COQ1P18900 YNL205CYNL205C 423 nt-1.51□□□□□ -2.65
COQ1P18900 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-1.52□□□□□ -2.65
COQ1P18900 snR77snR77 88 nt-1.54□□□□□ -2.66
COQ1P18900 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.54□□□□□ -2.66
COQ1P18900 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-1.54□□□□□ -2.66
COQ1P18900 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-1.56□□□□□ -2.66
COQ1P18900 YKL118WYKL118W 312 nt-1.56□□□□□ -2.66
COQ1P18900 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-1.56□□□□□ -2.66
COQ1P18900 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-1.57□□□□□ -2.66
COQ1P18900 VAR1Q0140 1197 nt-1.58□□□□□ -2.66
COQ1P18900 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.6□□□□□ -2.67
COQ1P18900 YBR178WYBR178W 375 nt-1.6□□□□□ -2.67
COQ1P18900 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-1.62□□□□□ -2.67
COQ1P18900 snR81snR81 201 nt-1.64□□□□□ -2.67
COQ1P18900 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.64□□□□□ -2.67
COQ1P18900 GIM4YEL003W 336 nt-1.64□□□□□ -2.67
COQ1P18900 YPR012WYPR012W 255 nt-1.64□□□□□ -2.67
COQ1P18900 snR55snR55 98 nt-1.65□□□□□ -2.67
COQ1P18900 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.66□□□□□ -2.68
COQ1P18900 snR48snR48 113 nt-1.77□□□□□ -2.69
COQ1P18900 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.82□□□□□ -2.7
COQ1P18900 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-1.83□□□□□ -2.7
COQ1P18900 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.84□□□□□ -2.7
COQ1P18900 YOR302WYOR302W 78 nt-1.85□□□□□ -2.71
COQ1P18900 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.87□□□□□ -2.71
COQ1P18900 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-1.88□□□□□ -2.71
COQ1P18900 YOR102WYOR102W 351 nt-1.88□□□□□ -2.71
COQ1P18900 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-1.91□□□□□ -2.72
COQ1P18900 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-1.92□□□□□ -2.72
COQ1P18900 YOR309CYOR309C 381 nt-1.93□□□□□ -2.72
COQ1P18900 snR65snR65 100 nt-1.96□□□□□ -2.72
COQ1P18900 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-2.02□□□□□ -2.73
COQ1P18900 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.02□□□□□ -2.73
COQ1P18900 snR52snR52 92 nt-2.02□□□□□ -2.73
COQ1P18900 Q0144Q0144 330 nt-2.04□□□□□ -2.74
COQ1P18900 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-2.05□□□□□ -2.74
COQ1P18900 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-2.05□□□□□ -2.74
COQ1P18900 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-2.05□□□□□ -2.74
COQ1P18900 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-2.12□□□□□ -2.75
COQ1P18900 YJL150WYJL150W 303 nt-2.21□□□□□ -2.76
COQ1P18900 YNL198CYNL198C 303 nt-2.23□□□□□ -2.77
COQ1P18900 snR80snR80 171 nt-2.26□□□□□ -2.77
COQ1P18900 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-2.26□□□□□ -2.77
COQ1P18900 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-2.27□□□□□ -2.77
COQ1P18900 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-2.27□□□□□ -2.77
COQ1P18900 snR6snR6 112 nt-2.31□□□□□ -2.78
COQ1P18900 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-2.31□□□□□ -2.78
COQ1P18900 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-2.31□□□□□ -2.78
COQ1P18900 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-2.37□□□□□ -2.79
COQ1P18900 RPL41AYDL184C 78 nt-2.38□□□□□ -2.79
COQ1P18900 SOM1YEL059C-A 225 nt-2.38□□□□□ -2.79
COQ1P18900 snR56snR56 88 nt-2.39□□□□□ -2.79
COQ1P18900 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-2.4□□□□□ -2.79
COQ1P18900 snR38snR38 95 nt-2.41□□□□□ -2.8
COQ1P18900 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.44□□□□□ -2.8
COQ1P18900 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-2.45□□□□□ -2.8
COQ1P18900 snR73snR73 106 nt-2.47□□□□□ -2.8
COQ1P18900 YBL053WYBL053W 375 nt-2.49□□□□□ -2.81
COQ1P18900 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-2.52□□□□□ -2.81
COQ1P18900 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.59□□□□□ -2.82
COQ1P18900 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-2.59□□□□□ -2.82
COQ1P18900 YGR151CYGR151C 336 nt-2.63□□□□□ -2.83
COQ1P18900 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-2.64□□□□□ -2.83
COQ1P18900 snR47snR47 99 nt-2.7□□□□□ -2.84
COQ1P18900 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.8□□□□□ -2.86
COQ1P18900 YDR543CYDR543C 300 nt-2.8□□□□□ -2.86
COQ1P18900 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.81□□□□□ -2.86
COQ1P18900 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.84□□□□□ -2.86
COQ1P18900 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-2.85□□□□□ -2.87
COQ1P18900 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-2.85□□□□□ -2.87
COQ1P18900 snR85snR85 171 nt-2.88□□□□□ -2.87
COQ1P18900 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.88□□□□□ -2.87
COQ1P18900 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-2.89□□□□□ -2.87
COQ1P18900 YKL225WYKL225W 348 nt-2.91□□□□□ -2.88
COQ1P18900 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.94□□□□□ -2.88
COQ1P18900 SPG3YDR504C 384 nt-2.97□□□□□ -2.88
COQ1P18900 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-2.97□□□□□ -2.88
COQ1P18900 snR87snR87 109 nt-3.11□□□□□ -2.91
COQ1P18900 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-3.2□□□□□ -2.92
COQ1P18900 YNL337WYNL337W 255 nt-3.21□□□□□ -2.92
COQ1P18900 Q0142Q0142 177 nt-3.23□□□□□ -2.93
COQ1P18900 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-3.24□□□□□ -2.93
COQ1P18900 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-3.25□□□□□ -2.93
COQ1P18900 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-3.27□□□□□ -2.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.2 ms