Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms