Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB1P16220 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB1P16220 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB1P16220 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms