Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms